RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TTC17Q96AE7 1141 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACAP3Q96P50 834 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OBP2AQ9NY56 170 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VWA7Q9Y334 891 aa6.34□□□□□ -1.39
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYP27B1O15528 508 aa6.33□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAP3K12Q12852 859 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PICALMQ13492 652 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRRC32Q14392 662 aa6.33□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TERF2Q15554 542 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NME9Q86XW9 330 aa6.32□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CEP72Q9P209 647 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.32□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CAPN14A8MX76 684 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IL33O95760 270 aa6.31□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 INHBCP55103 352 aa6.31□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TOMM22Q9NS69 142 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TGM5O43548 720 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PEX11BO96011 259 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADH4P08319 380 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAKP20794 623 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.3□□□□□ -1.4
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SARGQ9BW04 601 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANO9A1A5B4 782 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MTHFD2P13995 350 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIF11P52732 1056 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SCAND1P57086 179 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADAM15Q13444 863 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLUL1Q15846 466 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TPH2Q8IWU9 490 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.29□□□□□ -1.4
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