RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 A0A087WWV3 80 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 MEIS3P2A8K0S8 358 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 PTPN5P54829 565 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 GLB1LQ6UWU2 654 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 DTHD1Q6ZMT9 781 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 VPS52Q8N1B4 723 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 IGSF21Q96ID5 467 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 RAB34Q9BZG1 259 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 POMKQ9H5K3 350 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 MTMR6Q9Y217 621 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 NR2E1Q9Y466 385 aa28.34■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 RESTQ13127 1097 aa28.33■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 NOMO2Q5JPE7 1267 aa28.33■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 CES5AQ6NT32 575 aa28.33■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 CATSPER4Q7RTX7 472 aa28.33■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 NLRP4Q96MN2 994 aa28.33■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa28.33■■■□□ 2.13
RP9-201ENST00000297157 OFD1O75665 1012 aa28.32■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 CXCL14O95715 111 aa28.32■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 CTSAP10619 480 aa28.32■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 TCF15Q12870 199 aa28.32■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 HYIQ5T013 277 aa28.32■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa28.32■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 DZANK1Q9NVP4 752 aa28.32■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 GALTP07902 379 aa28.31■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 SP100P23497 879 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 GIT2Q14161 759 aa28.31■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 NFKBIZQ9BYH8 718 aa28.31■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 MINDY3Q9H8M7 445 aa28.31■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 PP2D1A8MPX8 630 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 C2CD4DB7Z1M9 353 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 B4GALT3O60512 393 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 BMP15O95972 392 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 MTHFRP42898 656 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 VCPP55072 806 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 PTENP60484 403 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 LONRF3Q496Y0 759 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 KCTD17Q8N5Z5 321 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 ASAP3Q8TDY4 903 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 AUTS2Q8WXX7 1259 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 PHOX2BQ99453 314 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 VN1R3Q9BXE9 311 aa28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 DENND4AQ7Z401 1863 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 CYP11B2P19099 503 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 GLRA2P23416 452 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 KIAA1841Q6NSI8 718 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 AGMOQ6ZNB7 445 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 MCPH1Q8NEM0 835 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 SNX29Q8TEQ0 813 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 SLC22A17Q8WUG5 538 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 RIPOR3Q96MK2 946 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 DNAJB4Q9UDY4 337 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 CDC25AP30304 524 aa28.28■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 SLC11A1P49279 550 aa28.28■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 CAPSQ13938 189 aa28.28■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 RNF149Q8NC42 400 aa28.28■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 KREMEN2Q8NCW0 462 aa28.28■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 PGBD4Q96DM1 585 aa28.28■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 SORCS3Q9UPU3 1222 aa28.28■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 KIAA1024Q9UPX6 916 aa28.28■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 STX6O43752 255 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 USO1O60763 962 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 EPCAMP16422 314 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 CA8P35219 290 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 PTPAQ15257 358 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 PTPN14Q15678 1187 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 KRT79Q5XKE5 535 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 PADI6Q6TGC4 694 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 ZBTB33Q86T24 672 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 ZNF280BQ86YH2 543 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 HSCBQ8IWL3 235 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 UBALD2Q8IYN6 164 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 AK8Q96MA6 479 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 MYO10Q9HD67 2058 aa28.27■■■□□ 2.12
RP9-201ENST00000297157 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa28.26■■■□□ 2.11
RP9-201ENST00000297157 AVPR2P30518 371 aa28.26■■■□□ 2.11
RP9-201ENST00000297157 MTMR3Q13615 1198 aa28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms