RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000286428.5

VBP1-201, Transcript of VHL binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VBP1, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1-201ENST00000286428 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.56■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 A0A0U1RQJ8 604 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 F8VZ95 297 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 ZNF263O14978 683 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.884e-6■□□□□ 8.7
VBP1-201ENST00000286428 DLG4P78352 724 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 APBA1Q02410 837 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 PTK2Q05397 1052 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 PPP3CAQ08209 521 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 TINF2Q9BSI4 451 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 LACRTQ9GZZ8 138 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 COL1A2P08123 1366 aa20.55■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 WDR81Q562E7 1941 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 MFAP3P55082 362 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 POU5F1BQ06416 359 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 CAPSQ13938 189 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 MAPK6Q16659 721 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 RGMBQ6NW40 437 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 LMO3Q8TAP4 145 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 UBXN4Q92575 508 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 COPS5Q92905 334 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 NOX5Q96PH1 765 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 INTUQ9ULD6 942 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 ADRB2P07550 413 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 TMOD1P28289 359 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 GPC3P51654 580 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 ACVR2BQ13705 512 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 PSMD6Q15008 389 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 FANCGO15287 622 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 EVI5O60447 810 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 HOXC6P09630 235 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 AP3M2P53677 418 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 SURF1Q15526 300 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 NAB2Q15742 525 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 MAP7D2Q96T17 732 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 TSKSQ9UJT2 592 aa20.53■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 A0A087X0T9 212 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 CLDN3O15551 220 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 TOM1L1O75674 476 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 ABL1P00519 1130 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 LGALS2P05162 132 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 FAM228BP0C875 321 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 CLDN10P78369 228 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 TRIM50Q86XT4 487 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 CARD6Q9BX69 1037 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 KATNBL1Q9H079 304 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 RAB20Q9NX57 234 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.52■□□□□ 0.88
VBP1-201ENST00000286428 A0A0B4J269 797 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 RCCD1A6NED2 376 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 SREBF2Q12772 1141 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 MAP2K5Q13163 448 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 DGKDQ16760 1214 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 RNF149Q8NC42 400 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 CCDC102AQ96A19 550 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 NT5C1BQ96P26 610 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.51■□□□□ 0.87
VBP1-201ENST00000286428 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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