RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.02	□□□□□ -1.93	not detected
TOP1	YOL006C	YCR041W	P37265	110 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YBP1	P38315	674 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.02	□□□□□ -1.93	not detected
TOP1	YOL006C	IRC24	P40580	263 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	COS4	P43542	379 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YFH7	P43591	353 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YJL016W	P47072	561 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	JAC1	P53193	184 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SOL4	P53315	255 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RCF2	P53721	224 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	FRE4	P53746	719 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	KIN4	Q01919	800 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ABF2	Q02486	183 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ARO80	Q04052	950 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SSK1	Q07084	712 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MFG1	Q07684	458 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	HNT3	Q08702	217 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YDR018C	Q12185	396 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YDL009C	Q12210	107 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SFM1	Q12314	213 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ARP6	Q12509	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TFS1	P14306	219 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SLY1	P22213	666 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SPO11	P23179	398 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SNC1	P31109	117 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	BDH1	P39714	382 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ERV46	P39727	415 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ARG2	P40360	574 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	PHB1	P40961	287 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	IRC18	P47056	224 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	BRR6	P53062	197 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MRM2	P53123	320 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SWC4	P53201	476 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	GOR1	P53839	350 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YLR152C	P54072	576 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	STP1	Q00947	519 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	BET5	Q03630	159 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SNX41	Q04053	625 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SFH1	Q06168	426 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YLR122C	Q12312	125 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RAD50	P12753	1312 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	POM152	P39685	1337 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YCR007C	P25354	239 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	PMT2	P31382	759 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SPS18	P32572	300 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TCA17	P32613	152 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YEF1	P32622	495 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	CPR5	P35176	225 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	UPS2	P35200	230 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	GPX2	P38143	162 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	GOS1	P38736	223 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SHC1	P39000	512 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	APS3	P47064	194 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	FCY22	Q12119	530 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	CPR3	P25719	182 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	UBC8	P28263	218 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	KAR9	P32526	644 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ELM1	P32801	640 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SGE1	P33335	543 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TIP20	P33891	701 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YPC1	P38298	316 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SDS24	P38314	527 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	GEP4	P38812	185 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	NDT80	P38830	627 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MIT1	P40002	666 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MOG1	P47123	218 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	NBP35	P52920	328 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	PEX31	P53203	462 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YML096W	Q04489	525 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	GRX8	Q05926	109 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YPR127W	Q06494	345 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RFU1	Q08003	200 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YPR064W	Q12492	139 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	TAF2	P23255	1407 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	STH1	P32597	1359 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	CYC7	P00045	113 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	JEN1	P36035	616 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YBR096W	P38256	230 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	YHK8	P38776	514 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	PAC2	P39937	518 aa		3	□□□□□ -1.93
TOP1	YOL006C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93

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