RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	GIT2	Q14161	759 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX27	Q96L92	541 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	MARCH5	Q9NX47	278 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF292	O60281	2723 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338		F8W810	466 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	POMC	P01189	267 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	STK3	Q13188	491 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	HAS1	Q92839	578 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	LXN	Q9BS40	222 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR23A	A6NEV1	266 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	NRP1	O14786	923 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CPLX1	O14810	134 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB39	O15060	712 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	REC8	O95072	547 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	NBL1	P41271	181 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	EMC2	Q15006	297 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	POTED	Q86YR6	584 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP170P1	Q96L14	293 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	C2CD2L	O14523	706 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PI15	O43692	258 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN1	O60635	241 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	EFEMP2	O95967	443 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SOD2	P04179	222 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	NPR3	P17342	541 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	KLRC2	P26717	231 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	FLCN	Q8NFG4	579 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	HES2	Q9Y543	173 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	IPP	Q9Y573	584 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	INPPL1	O15357	1258 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX28	O15482	410 aa		13.33	□□□□□ -0.28

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