RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIF5CO60282 957 aa30.98■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-210ENST00000574322 VAMP7P51809 220 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-210ENST00000574322 APBA1Q02410 837 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-210ENST00000574322 LAMC2Q13753 1193 aa30.98■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-210ENST00000574322 AKR1B10O60218 316 aa30.93■■■□□ 2.54
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CTDNEP1-210ENST00000574322 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 DEF6Q9H4E7 631 aa30.93■■■□□ 2.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 KRT86O43790 486 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPP3CAQ08209 521 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 CETN1Q12798 172 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 IRF5Q13568 498 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIAA1328Q86T90 577 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDNEP1-210ENST00000574322 CBWD2Q8IUF1 395 aa30.92■■■□□ 2.54
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