RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 AXLP30530 894 aa14.84□□□□□ -0.03
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CCNDBP1-209ENST00000566833 PNOCQ13519 176 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 ALCAMQ13740 583 aa14.84□□□□□ -0.03
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CCNDBP1-209ENST00000566833 CHST12Q9NRB3 414 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.84□□□□□ -0.03
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CCNDBP1-209ENST00000566833 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.83□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 HVCN1Q96D96 273 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 CPB2Q96IY4 423 aa14.83□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 ADAM2Q99965 735 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 TBX20Q9UMR3 447 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 EXOC7Q9UPT5 735 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 N4BP3O15049 544 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 B4GALT5O43286 388 aa14.82□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 AMHP03971 560 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 CAMK4Q16566 473 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 HERVK_113Q902F9 699 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 HPS3Q969F9 1004 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 VWCEQ96DN2 955 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC51Q96ER9 411 aa14.82□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMX1Q9H3N1 280 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ENPP3O14638 875 aa14.81□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 BMP8BP34820 402 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 LIG4P49917 911 aa14.81□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 SHHQ15465 462 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 AMHR2Q16671 573 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 TCTN1Q2MV58 587 aa14.81□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.81□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 GPT2Q8TD30 523 aa14.81□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 GSDMAQ96QA5 445 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ACCSQ96QU6 501 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 FIZ1Q96SL8 496 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 TCHPQ9BT92 498 aa14.81□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 RGS18Q9NS28 235 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.81□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 MGEA5O60502 916 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 RHOBTB3O94955 611 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIF20AO95235 890 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 STAG3L1P0CL83 205 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 RAB27AP51159 221 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 DSC3Q14574 896 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZPBP2Q6X784 338 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.8□□□□□ -0.04
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