RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 CABP7Q86V35 215 aa26.73■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 ZNF280BQ86YH2 543 aa26.73■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 SLC22A17Q8WUG5 538 aa26.73■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 TCP11Q8WWU5 503 aa26.73■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 LXNQ9BS40 222 aa26.73■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 KANSL3Q9P2N6 904 aa26.73■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 STK36Q9NRP7 1315 aa26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 YWHABP31946 246 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 PTPN14Q15678 1187 aa26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 AGMOQ6ZNB7 445 aa26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 C4orf19Q8IY42 314 aa26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 PLCD3Q8N3E9 789 aa26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 USTQ9Y2C2 406 aa26.72■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 ASAP2O43150 1006 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 BRD1O95696 1058 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 ALDH2P05091 517 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 NUBP1P53384 320 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 KANK3Q6NY19 840 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 HAS1Q92839 578 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 TMEM175Q9BSA9 504 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
PBX1-217ENST00000559578 DDHD2O94830 711 aa26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 EMC2Q15006 297 aa26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 NCAPH2Q6IBW4 605 aa26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 SLFN12Q8IYM2 578 aa26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 RNF149Q8NC42 400 aa26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 CNNM3Q8NE01 707 aa26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 SFXN1Q9H9B4 322 aa26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26.7■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 CACNA1HO95180 2353 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 B4GALT3O60512 393 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 ERLIN2O94905 339 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 KLRC2P26717 231 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 XKR9Q5GH70 373 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 UBXN11Q5T124 520 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 FERMT3Q86UX7 667 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 POTEDQ86YR6 584 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 OXER1Q8TDS5 423 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 UBN1Q9NPG3 1134 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 RGL1Q9NZL6 768 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.69■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 DYDC2Q96IM9 177 aa26.68■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 KLHL5Q96PQ7 755 aa26.68■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 MTRQ99707 1265 aa26.68■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 GJB4Q9NTQ9 266 aa26.68■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 PFKFB2O60825 505 aa26.67■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 POMCP01189 267 aa26.67■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 ASGR2P07307 311 aa26.67■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 CYP4A11Q02928 519 aa26.67■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 WASF1Q92558 559 aa26.67■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 NRP1O14786 923 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 CNPP09543 421 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 ITGA4P13612 1032 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 AXLP30530 894 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 CLCN4P51793 760 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 GPR149Q86SP6 731 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 TPH2Q8IWU9 490 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 ARID2Q68CP9 1835 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 SOD2P04179 222 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 SPIRE1Q08AE8 756 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 NOTUMQ6P988 496 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 SMOC2Q9H3U7 446 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 IPPQ9Y573 584 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 DENND4AQ7Z401 1863 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 ZBTB39O15060 712 aa26.64■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
PBX1-217ENST00000559578 LILRB3O75022 631 aa26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms