RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 LMO3Q8TAP4 145 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 STK33Q9BYT3 514 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF302Q9NR11 478 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 NENFQ9UMX5 172 aa8.92□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 EMSYQ7Z589 1322 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 F8VZ95 297 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SORBS3O60504 671 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 OATP04181 439 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 TGFB3P10600 412 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PRLRP16471 622 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 OSBPP22059 807 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ADSSP30520 456 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ABCD1P33897 745 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 STAT1P42224 750 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SOX10P56693 466 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 NEDD9Q14511 834 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 NAB2Q15742 525 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MTERF2Q49AM1 385 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 KCNN1Q92952 543 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 NOX5Q96PH1 765 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PTPN18Q99952 460 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 EPC1Q9H2F5 836 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PLXNB2O15031 1838 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 BTBD19C9JJ37 291 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 H0YCG3 227 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GFPT2O94808 682 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 KLRC1P26715 233 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SOX5P35711 763 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 TM4SF4P48230 202 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PPP3CAQ08209 521 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CETN1Q12798 172 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 EMC2Q15006 297 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 EPC2Q52LR7 807 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 IFNL1Q8IU54 200 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 IFT74Q96LB3 600 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 FBXL18Q96ME1 805 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GPR88Q9GZN0 384 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 NAGPAQ9UK23 515 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SNX12Q9UMY4 172 aa8.91□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PDHXO00330 501 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 EVI5O60447 810 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SRGAP2O75044 1071 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ADRB2P07550 413 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SCP2P22307 547 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 Q3C1V9 767 aa8.9□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 VPS36Q86VN1 386 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 FGD4Q96M96 766 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CEP89Q96ST8 783 aa8.9□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.9□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.9□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.9□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 BUB1O43683 1085 aa8.9□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC172P0C7W6 258 aa8.9□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 GARTP22102 1010 aa8.9□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ENPEPQ07075 957 aa8.9□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
PDE4D-208ENST00000502484 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.9□□□□□ -0.99
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