RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 EMC2Q15006 297 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 ME3Q16798 604 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 XKR9Q5GH70 373 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 C4orf19Q8IY42 314 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 RNF149Q8NC42 400 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 IGSF21Q96ID5 467 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 JAK2O60674 1132 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 SLITRK3O94933 977 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 SKIP12755 728 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 KRT2P35908 639 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 RFC5P40937 340 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 FERMT3Q86UX7 667 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 TPH2Q8IWU9 490 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 PRSS33Q8NF86 280 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 CPB2Q96IY4 423 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 PHOX2BQ99453 314 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-212ENST00000485532 BTBD18B2RXH4 712 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 POMCP01189 267 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 CTSAP10619 480 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 RAB27AP51159 221 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 PTPN21Q16825 1174 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 GTF3C6Q969F1 213 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 PGBD4Q96DM1 585 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 ASIC4Q96FT7 647 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 MTRQ99707 1265 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 RNF39Q9H2S5 420 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 RSAD1Q9HA92 442 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 HES2Q9Y543 173 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 PIEZO1Q92508 2521 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 F8W810 466 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 MRE11P49959 708 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 ST3GAL1Q11201 340 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD1Q15327 319 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 PTPN14Q15678 1187 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 CALCRLQ16602 461 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 CES5AQ6NT32 575 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 HSCBQ8IWL3 235 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 URGCPQ8TCY9 931 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 TCP11Q8WWU5 503 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 WASF1Q92558 559 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 MIOSQ9NXC5 875 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.07□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 PLXNA3P51805 1871 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 NRP1O14786 923 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 TSPAN1O60635 241 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 TXKP42681 527 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 MCM2P49736 904 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 GUCY1B3Q02153 619 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 ITIH3Q06033 890 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 CAPSQ13938 189 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB33Q86T24 672 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 FBXL6Q8N531 539 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 KCNH6Q9H252 994 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.06□□□□□ -0.16
PRAME-212ENST00000485532 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
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