RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT7AO00755 349 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERLIN2O94905 339 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC24BO95487 1268 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBXN11Q5T124 520 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBP1Q9H171 429 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSAD1Q9HA92 442 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJB4Q9UDY4 337 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFDP1Q14186 410 aa29.16■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPRNQ4KMQ1 711 aa29.16■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM87AQ8NBN3 555 aa29.16■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTMR9Q96QG7 549 aa29.16■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DGAT1O75907 488 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC11A1P49279 550 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTENP60484 403 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST3GAL1Q11201 340 aa29.15■■■□□ 2.26
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HFE2Q6ZVN8 426 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF280BQ86YH2 543 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AUTS2Q8WXX7 1259 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KANSL3Q9P2N6 904 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTSAP10619 480 aa29.14■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCLP19338 710 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GIT2Q14161 759 aa29.14■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNNM3Q8NE01 707 aa29.14■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa29.14■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRAK3Q9Y616 596 aa29.14■■■□□ 2.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4GALT3O60512 393 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN1O60635 241 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AXLP30530 894 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GUCY1B3Q02153 619 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POU5F1BQ06416 359 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CES5AQ6NT32 575 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBN1Q9NPG3 1134 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDHD2O94830 711 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGA4P13612 1032 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP2B1P20020 1258 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCM7P33993 719 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARL2P36404 184 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RARRES1P49788 294 aa29.12■■■□□ 2.25
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIGOQ8TEQ8 1089 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC51Q96ER9 411 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD14AQ96MC6 490 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM175Q9BSA9 504 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM60Q9H2L4 133 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK39Q9UEW8 545 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUC6Q6W4X9 2439 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POTEMA6NI47 508 aa29.11■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POMCP01189 267 aa29.11■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH2P05091 517 aa29.11■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZXDAP98168 799 aa29.11■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITIH3Q06033 890 aa29.11■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM67Q6ZTA4 783 aa29.11■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC83Q8IWF9 413 aa29.11■■■□□ 2.25
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM7Q9H2U9 754 aa29.11■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IPPQ9Y573 584 aa29.11■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBTD1Q05BQ5 628 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPB2Q96IY4 423 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C8orf76Q96K31 380 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NECTIN4Q96NY8 510 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DZANK1Q9NVP4 752 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAN1Q9Y2M0 1017 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TECTAO75443 2155 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A087WWV3 80 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLRA2P23416 452 aa29.09■■■□□ 2.25
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFKBIZQ9BYH8 718 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSRNP2Q9H175 543 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH22Q9UJ99 828 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NR2E1Q9Y466 385 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM221A6NGB7 291 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0R296 226 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USO1O60763 962 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPCAMP16422 314 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SP100P23497 879 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPN14Q15678 1187 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMHR2Q16671 573 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUFT1Q9NNX1 390 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRP1O14786 923 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa29.07■■■□□ 2.24
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