RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439424.6

C17orf49-201, Transcript of chromosome 17 open reading frame 49, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C17orf49, Length 850 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf49-201ENST00000439424 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
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C17orf49-201ENST00000439424 ZNF558Q96NG5 402 aa26.64■■□□□ 1.86
C17orf49-201ENST00000439424 PNMA5Q96PV4 448 aa26.64■■□□□ 1.86
C17orf49-201ENST00000439424 MUC3AQ02505 3323 aa26.64■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 RESTQ13127 1097 aa26.63■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 NOMO2Q5JPE7 1267 aa26.63■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 PGBD4Q96DM1 585 aa26.63■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 KIFC3Q9BVG8 833 aa26.63■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 CSRNP2Q9H175 543 aa26.63■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 TBC1D13Q9NVG8 400 aa26.63■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 B4GALT3O60512 393 aa26.62■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 CCDC51Q96ER9 411 aa26.62■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 TLR9Q9NR96 1032 aa26.62■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 DNM3Q9UQ16 869 aa26.62■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 HES2Q9Y543 173 aa26.62■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 TTLL13PA6NNM8 815 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 BCAR1P56945 870 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 ERVFC1P60507 584 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 EP400NLQ6ZTU2 488 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 DAW1Q8N136 415 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 SLC39A11Q8N1S5 342 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 SNX21Q969T3 373 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 PLIN2Q99541 437 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 CCDC113Q9H0I3 377 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 CLDND1Q9NY35 253 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.61■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa26.6■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 LINC01565O15544 149 aa26.6■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 PLCB3Q01970 1234 aa26.6■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 FZD8Q9H461 694 aa26.6■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 IGFLR1Q9H665 355 aa26.6■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 SPG21Q9NZD8 308 aa26.6■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 MTMR6Q9Y217 621 aa26.6■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 USP20Q9Y2K6 914 aa26.6■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 BDP1A6H8Y1 2624 aa26.59■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 NPTXRO95502 500 aa26.59■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 ITGA4P13612 1032 aa26.59■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.59■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 DEPTORQ8TB45 409 aa26.59■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 RSPH1Q8WYR4 309 aa26.59■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 KIFAP3Q92845 792 aa26.59■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 APOL6Q9BWW8 343 aa26.59■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 GBP3Q9H0R5 595 aa26.59■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 C2orf40Q9H1Z8 148 aa26.59■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 LZTS1Q9Y250 596 aa26.59■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 CLIC4Q9Y696 253 aa26.59■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 FSCN2O14926 492 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 HIP1RO75146 1068 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 TBX10O75333 385 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 PRKCBP05771 671 aa26.58■■□□□ 1.85
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C17orf49-201ENST00000439424 CTC1Q2NKJ3 1217 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 LEXMQ3ZCV2 418 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 PLPP4Q5VZY2 271 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 SLC27A1Q6PCB7 646 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 CABP7Q86V35 215 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 ZNF280BQ86YH2 543 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 CNNM3Q8NE01 707 aa26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
C17orf49-201ENST00000439424 URGCPQ8TCY9 931 aa26.58■■□□□ 1.85
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