RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TBX3O15119 743 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CBFA2T3O75081 653 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 GTF2H1P32780 548 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 VHLP40337 213 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 STARD8Q92502 1023 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ADPGKQ9BRR6 497 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NUP85Q9BW27 656 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 C17orf75Q9HAS0 396 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 VPS4BO75351 444 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PDE1BQ01064 536 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MYL7Q01449 175 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CHRNDQ07001 517 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 DMPKQ09013 629 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LRMPQ12912 555 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 IFT88Q13099 833 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KARSQ15046 597 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 MCPH1Q8NEM0 835 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 IL17RAQ96F46 866 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TEKT3Q9BXF9 490 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PANK2Q9BZ23 570 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 HESX1Q9UBX0 185 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 MT-ND3P03897 115 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SFNP31947 248 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KCNQ4P56696 695 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 WLSQ5T9L3 541 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FLT1P17948 1338 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 GDF11O95390 407 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ELF1P32519 619 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RRAGAQ7L523 313 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF555Q8NEP9 628 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 RDM1Q8NG50 284 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 DCAF4Q8WV16 495 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TLK1Q9UKI8 766 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.22□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 DGKHQ86XP1 1220 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00301Q8NCQ3 95 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 TLDC2A0PJX2 215 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ALOX5P09917 674 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 CPA3P15088 417 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SOX6P35712 828 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 ARMCX2Q7L311 632 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 CALML6Q8TD86 181 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 PIGBQ92521 554 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 FANCEQ9HB96 536 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 STOML2Q9UJZ1 356 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 BTDP43251 543 aa5.21□□□□□ -1.57
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PTPRD-201ENST00000355233 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf40Q9H1Z8 148 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 ATAD3AQ9NVI7 634 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRD-201ENST00000355233 LAMB4A4D0S4 1761 aa5.21□□□□□ -1.57
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