RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564601.5

RNPS1-210, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene RNPS1, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-210ENST00000564601 PLCB3Q01970 1234 aa21.45■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 COASYQ13057 564 aa21.45■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 EMC2Q15006 297 aa21.45■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 DUSP6Q16828 381 aa21.45■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 TPH2Q8IWU9 490 aa21.45■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 LRRC43Q8N309 656 aa21.45■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 RNF169Q8NCN4 708 aa21.45■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 HELQQ8TDG4 1101 aa21.45■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.45■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 B4GALT3O60512 393 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 LYPLA2O95372 231 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 MCM7P33993 719 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 NDUFV1P49821 464 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 XKR9Q5GH70 373 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 ABI1Q8IZP0 508 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 TMEM143Q96AN5 459 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 LZTS1Q9Y250 596 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 TECTAO75443 2155 aa21.44■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 HIDE1A8MVS5 230 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 EOMESO95936 686 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 ATP2B1P20020 1258 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 PHKA2P46019 1235 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 RABEP1Q15276 862 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 TCP11Q8WWU5 503 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 LPPQ93052 612 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 ALADP13716 330 aa21.42■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.42■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.42■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 MTRQ99707 1265 aa21.42■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.42■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 POTEMA6NI47 508 aa21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 SUSD6Q92537 303 aa21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF558Q96NG5 402 aa21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 TLE6Q9H808 572 aa21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 FAM50BQ9Y247 325 aa21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 ASAP2O43150 1006 aa21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 DCXO43602 365 aa21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 SKIP12755 728 aa21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 LONRF3Q496Y0 759 aa21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 UBXN11Q5T124 520 aa21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 FERMT3Q86UX7 667 aa21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 TCF25Q9BQ70 676 aa21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.4■■□□□ 1.02
RNPS1-210ENST00000564601 LOC730098B7Z3J9 87 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 ST18O60284 1047 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 PPM1AP35813 382 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 RAB27AP51159 221 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 RNF149Q8NC42 400 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 S1PR5Q9H228 398 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.39■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.38■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF623O75123 536 aa21.38■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 DGAT1O75907 488 aa21.38■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 OR52Z1P0C646 297 aa21.38■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 TRAPPC10P48553 1259 aa21.38■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 RARRES1P49788 294 aa21.38■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 BCAR1P56945 870 aa21.38■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF174Q15697 407 aa21.38■■□□□ 1.01
RNPS1-210ENST00000564601 TTC38Q5R3I4 469 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms