RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, human

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC13-208	ENST00000522399	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	RNF135	Q8IUD6	432 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	TCP11	Q8WWU5	503 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	RGL1	Q9NZL6	768 aa		27.62	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	FAM205C	A6NFA0	338 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	LARGE1	O95461	756 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	NEK4	P51957	841 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	BCAR1	P56945	870 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	TRIM29	Q14134	588 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	XKR9	Q5GH70	373 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	TNFRSF25	Q93038	417 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	TMEM143	Q96AN5	459 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	PGBD4	Q96DM1	585 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	TMEM169	Q96HH4	297 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	DYDC2	Q96IM9	177 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	ARID2	Q68CP9	1835 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	HIDE1	A8MVS5	230 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF623	O75123	536 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	CYP4A11	Q02928	519 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	EMC2	Q15006	297 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	LPP	Q93052	612 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	ASAP2	O43150	1006 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	27.59	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	TEC	P42680	631 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	KCNC3	Q14003	757 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	CALCRL	Q16602	461 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	LONRF3	Q496Y0	759 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	TPH2	Q8IWU9	490 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	MTR	Q99707	1265 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC13-208	ENST00000522399	BTBD18	B2RXH4	712 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	CA8	P35219	290 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	FERMT3	Q86UX7	667 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	RNF149	Q8NC42	400 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	SUSD6	Q92537	303 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	CASP10	Q92851	521 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	NEMF	O60524	1076 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	JAK2	O60674	1132 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	OFD1	O75665	1012 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	SLITRK3	O94933	977 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	URGCP	Q8TCY9	931 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	ZBTB39	O15060	712 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	ERLIN2	O94905	339 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	FOSB	P53539	338 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	VPS52	Q8N1B4	723 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	S1PR5	Q9H228	398 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	LYPLA2	O95372	231 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	CXCL14	O95715	111 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	27.54	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	IGSF21	Q96ID5	467 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	GBP3	Q9H0R5	595 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	GALT	P07902	379 aa		27.53	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
TTC13-208	ENST00000522399	TXK	P42681	527 aa		27.53	■■■□□ 2

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