RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 RWDD3Q9Y3V2 267 aa4.86□□□□□ -1.63
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ECHDC1-211ENST00000460558 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.86□□□□□ -1.63
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ECHDC1-211ENST00000460558 NETO1Q8TDF5 533 aa4.84□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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ECHDC1-211ENST00000460558 BORCS6Q96GS4 357 aa4.84□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 SH2D4AQ9H788 454 aa4.84□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 SNTG2Q9NY99 539 aa4.84□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.84□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 USP18Q9UMW8 372 aa4.84□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 DOCK8Q8NF50 2099 aa4.84□□□□□ -1.64
ECHDC1-211ENST00000460558 DENND4AQ7Z401 1863 aa4.83□□□□□ -1.64
ECHDC1-211ENST00000460558 ITPR1Q14643 2758 aa4.83□□□□□ -1.64
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