RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 KRT17Q04695 432 aa29.75■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 GJD3Q8N144 294 aa29.75■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 HELQQ8TDG4 1101 aa29.75■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 FSCN2O14926 492 aa29.74■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa29.74■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 MCM7P33993 719 aa29.74■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
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ODC1-204ENST00000446285 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa29.74■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 PGBD4Q96DM1 585 aa29.74■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 TLE6Q9H808 572 aa29.74■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 SPG21Q9NZD8 308 aa29.74■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 TBX10O75333 385 aa29.73■■■□□ 2.35
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ODC1-204ENST00000446285 TRAPPC10P48553 1259 aa29.73■■■□□ 2.35
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ODC1-204ENST00000446285 RABEP1Q15276 862 aa29.73■■■□□ 2.35
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ODC1-204ENST00000446285 RNF149Q8NC42 400 aa29.73■■■□□ 2.35
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ODC1-204ENST00000446285 CD207Q9UJ71 328 aa29.73■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB39O15060 712 aa29.72■■■□□ 2.35
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ODC1-204ENST00000446285 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa29.72■■■□□ 2.35
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ODC1-204ENST00000446285 ST18O60284 1047 aa29.7■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 OR52Z1P0C646 297 aa29.7■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 AXLP30530 894 aa29.7■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
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ODC1-204ENST00000446285 PTENP60484 403 aa29.7■■■□□ 2.35
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ODC1-204ENST00000446285 SLC39A11Q8N1S5 342 aa29.7■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 ERMNQ8TAM6 284 aa29.7■■■□□ 2.35
ODC1-204ENST00000446285 CCDC51Q96ER9 411 aa29.7■■■□□ 2.35
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ODC1-204ENST00000446285 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa29.7■■■□□ 2.34
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ODC1-204ENST00000446285 TCF25Q9BQ70 676 aa29.69■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
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ODC1-204ENST00000446285 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa29.69■■■□□ 2.34
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ODC1-204ENST00000446285 TTC38Q5R3I4 469 aa29.68■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
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ODC1-204ENST00000446285 NACC1Q96RE7 527 aa29.67■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 C19orf67A6NJJ6 358 aa29.66■■■□□ 2.34
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ODC1-204ENST00000446285 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa29.66■■■□□ 2.34
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ODC1-204ENST00000446285 PBX3P40426 434 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 TECP42680 631 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 TMC7Q7Z402 723 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 CATSPER3Q86XQ3 398 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 SMRP1Q8NCR6 262 aa29.66■■■□□ 2.34
ODC1-204ENST00000446285 MCPH1Q8NEM0 835 aa29.66■■■□□ 2.34
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