RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAGE1Q8TC20 777 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 DLG3Q92796 817 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDC6Q99741 560 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 TLK1Q9UKI8 766 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 AHRRA9YTQ3 701 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 BMPR1AP36894 532 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 RGS3P49796 1198 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 GUCY1B3Q02153 619 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 NHLH1Q02575 133 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 FOXF2Q12947 444 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 VPS72Q15906 364 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 DDB1Q16531 1140 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 FSTL4Q6MZW2 842 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 NDC1Q9BTX1 674 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 EPC1Q9H2F5 836 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNAI1Q9UI46 699 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 DIRC3C9JPN6 131 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAFGO15525 162 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 NCR1O76036 304 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 STC2O76061 302 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZFPL1O95159 310 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CRTAMO95727 393 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 FGRP09769 529 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANTXR2P58335 489 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC6A3Q01959 620 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLFN12LQ6IEE8 588 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM83AQ86UY5 434 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF366Q8N895 744 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR52N2Q8NGI0 321 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANKS1AQ92625 1134 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAML3Q96JK9 1138 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 DUSP26Q9BV47 211 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPATA9Q9BWV2 254 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 HAPLN2Q9GZV7 340 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLCA2Q9UQC9 943 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 PIPSLA2A3N6 862 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNAJC6O75061 913 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 RASGRP1O95267 797 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 NDUFA10O95299 355 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 ESRRBO95718 433 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 ONECUT2O95948 504 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 HLA-DOAP06340 250 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPATA31D3P0C874 917 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTH2RP49190 550 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 WNT3AP56704 352 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM189BP81408 668 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 MXRA7P84157 204 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 IRF9Q00978 393 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 FOXI1Q12951 378 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 MPP3Q13368 585 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAN2A1Q16706 1144 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 DOK3Q7L591 496 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 ACSS2Q9NR19 701 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 HDAC5Q9UQL6 1122 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGLV2-14P01704 120 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 BCAR1P56945 870 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 TTC38Q5R3I4 469 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMCO4Q5TGY1 634 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANKS3Q6ZW76 656 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 BRAPQ7Z569 592 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 UIMC1Q96RL1 719 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 BOCQ9BWV1 1114 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 KMT5AQ9NQR1 393 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU2-38P-201ENST00000410856 DKK2Q9UBU2 259 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms