RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 NCKAP1LP55160 1127 aa32.59■■■□□ 2.81
ECHS1-201ENST00000368547 NLRP12P59046 1061 aa32.59■■■□□ 2.81
ECHS1-201ENST00000368547 POU5F1BQ06416 359 aa32.59■■■□□ 2.81
ECHS1-201ENST00000368547 FAM26FQ5R3K3 315 aa32.59■■■□□ 2.81
ECHS1-201ENST00000368547 MAN1B1Q9UKM7 699 aa32.59■■■□□ 2.81
ECHS1-201ENST00000368547 DEKP35659 375 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
ECHS1-201ENST00000368547 PHKA2P46019 1235 aa32.58■■■□□ 2.81
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ECHS1-201ENST00000368547 PTENP60484 403 aa32.58■■■□□ 2.81
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ECHS1-201ENST00000368547 FAM26DQ5JW98 314 aa32.58■■■□□ 2.81
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ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa32.58■■■□□ 2.81
ECHS1-201ENST00000368547 SLC39A2Q9NP94 309 aa32.58■■■□□ 2.81
ECHS1-201ENST00000368547 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
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ECHS1-201ENST00000368547 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC17A8Q8NDX2 589 aa32.55■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 DENND3A2RUS2 1198 aa32.54■■■□□ 2.8
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM43BA6NCK2 446 aa32.54■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 CYP2C18P33260 490 aa32.54■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0895Q8NCT3 520 aa32.54■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 BPIFA3Q9BQP9 254 aa32.53■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa32.53■■■□□ 2.8
ECHS1-201ENST00000368547 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa32.52■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 MORC3Q14149 939 aa32.52■■■□□ 2.8
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 K7ERI5 159 aa32.51■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 GTF2BQ00403 316 aa32.51■■■□□ 2.8
ECHS1-201ENST00000368547 MBTPS1Q14703 1052 aa32.51■■■□□ 2.8
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ECHS1-201ENST00000368547 FBXO47Q5MNV8 452 aa32.51■■■□□ 2.79
ECHS1-201ENST00000368547 TAS1R3Q7RTX0 852 aa32.51■■■□□ 2.79
ECHS1-201ENST00000368547 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
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ECHS1-201ENST00000368547 TIMP1P01033 207 aa32.5■■■□□ 2.79
ECHS1-201ENST00000368547 GHRP10912 638 aa32.5■■■□□ 2.79
ECHS1-201ENST00000368547 FGFR4P22455 802 aa32.5■■■□□ 2.79
ECHS1-201ENST00000368547 ITGB8P26012 769 aa32.5■■■□□ 2.79
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
ECHS1-201ENST00000368547 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa32.5■■■□□ 2.79
ECHS1-201ENST00000368547 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
ECHS1-201ENST00000368547 DPF3Q92784 378 aa32.5■■■□□ 2.79
ECHS1-201ENST00000368547 SCLYQ96I15 445 aa32.5■■■□□ 2.79
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