RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 POU5F1BQ06416 359 aa22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 BSNDQ8WZ55 320 aa22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 CASD1Q96PB1 797 aa22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 ASB2Q96Q27 587 aa22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 POLD4Q9HCU8 107 aa22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 CLIC4Q9Y696 253 aa22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 STX6O43752 255 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 RB1P06400 928 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 TFF2Q03403 129 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 GRIN1Q05586 938 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 PNMA5Q96PV4 448 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.06■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 TSPAN1O60635 241 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 EYA4O95677 639 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 EOMESO95936 686 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 BMP15O95972 392 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 LONRF3Q496Y0 759 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 HYIQ5T013 277 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 UBXN11Q5T124 520 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 LPPQ93052 612 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 PLIN2Q99541 437 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 DNM3Q9UQ16 869 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 GRM6O15303 877 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 HOXA2O43364 376 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 ERLIN2O94905 339 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 PTPAQ15257 358 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 AMHR2Q16671 573 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 HELQQ8TDG4 1101 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 CPB2Q96IY4 423 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 PLVAPQ9BX97 442 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 CWH43Q9H720 699 aa22.04■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 ZNF623O75123 536 aa22.03■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 ABI1Q8IZP0 508 aa22.03■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.03■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.03■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.03■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.03■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 B4GALT5O43286 388 aa22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 ITGB1P05556 798 aa22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 SKIP12755 728 aa22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 RAB27AP51159 221 aa22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 PTPROQ16827 1216 aa22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 CABP7Q86V35 215 aa22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 P2RX5Q93086 422 aa22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 AK8Q96MA6 479 aa22.02■■□□□ 1.12
PARL-201ENST00000311101 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 AXLP30530 894 aa22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 LRRC43Q8N309 656 aa22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 LRRC15Q8TF66 581 aa22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.01■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 CSPG5O95196 566 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 DNAJB1P25685 340 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 NAMPTP43490 491 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 KCNQ1P51787 676 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 CAMK1Q14012 370 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 NAALADL2Q58DX5 795 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 NOTUMQ6P988 496 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 AGMOQ6ZNB7 445 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 DAW1Q8N136 415 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 SPPL3Q8TCT6 385 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 KIFAP3Q92845 792 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 USP28Q96RU2 1077 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 KIFC3Q9BVG8 833 aa22■■□□□ 1.11
PARL-201ENST00000311101 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms