RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KCNB1Q14721 858 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SLFN13Q68D06 897 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PDXDC1Q6P996 788 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM50Q86XT4 487 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ERP27Q96DN0 273 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 HOOK2Q96ED9 719 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 NRBF2Q96F24 287 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KRT82Q9NSB4 513 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 BPIFB4P59827 614 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 EVX2Q03828 476 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SFR1Q86XK3 245 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 HIC2Q96JB3 615 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MIS12Q9H081 205 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ESYT2A0FGR8 921 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 GNGT2O14610 69 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TTI1O43156 1089 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KCNQ2O43526 872 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 GDF11O95390 407 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MYBL1P10243 752 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MCF2P10911 925 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PGM1P36871 562 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RCAN1P53805 252 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MDM1Q8TC05 714 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.61■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SERPINB3P29508 390 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 COPB2P35606 906 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 STX1BP61266 288 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PLCB4Q15147 1175 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PDXDC2PQ6P474 469 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RAD54LQ92698 747 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ANP32DO95626 131 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MYBL2P10244 700 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MXI1P50539 228 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 DEPTORQ8TB45 409 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CFAP36Q96G28 342 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MCF2LO15068 1137 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RAD51CO43502 376 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 GRM4Q14833 912 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.6■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CYTH1Q15438 398 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 WDR93Q6P2C0 686 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RAB21Q9UL25 225 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 IFT172Q9UG01 1749 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MAP2K7O14733 419 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KRT37O76014 449 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SEC23AQ15436 765 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM59Q8IWR1 403 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 USP17L10C9JJH3 530 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 PAX7P23759 505 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 KDSRQ06136 332 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MED21Q13503 144 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 JDP2Q8WYK2 163 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 MTA3Q9BTC8 594 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 ANAPC7Q9UJX3 599 aa16.59■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 OCA2Q04671 838 aa16.58■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.58■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 SESTD1Q86VW0 696 aa16.58■□□□□ 0.25
KCNS1-201ENST00000306117 FBXO11Q86XK2 927 aa16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms