RNA–Protein interactions for RNA: YLR178C

TFS1, Transcript of Inhibitor of carboxypeptidase Y (Prc1p), and Ras GAP (Ira2p), yeast

Gene TFS1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TFS1	YLR178C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	NCE101	Q02820	53 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	ATG21	Q02887	496 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	PFA5	Q03289	374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	DCR2	Q05924	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	ARV1	Q06541	321 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	PSY3	Q12318	242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	KSS1	P14681	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	ERD1	P16151	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	YCK1	P23291	538 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	CLB4	P24871	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	YIM1	P28625	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	TPO5	P36029	618 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	SPC34	P36131	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	ANS1	P38832	159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	NSG1	P38837	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	ECM10	P39987	644 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	PKP1	P40530	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	FDC1	Q03034	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	NDL1	Q06568	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	SFG1	Q12507	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	MTR10	Q99189	972 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	BAR1	P12630	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	PTP2	P29461	750 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	HSP150	P32478	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	YPT7	P32939	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	LOT5	P34234	306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	SKG1	P36169	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	NUP57	P48837	541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	YGR168C	P53293	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	RRN5	Q02983	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	RSN1	Q03516	953 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	ARO10	Q06408	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	SWA2	Q06677	668 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	VPS36	Q06696	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	RDR1	Q08904	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	VIK1	Q12045	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	MRX4	Q12467	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TFS1	YLR178C	ERD2	P18414	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	ADH7	P25377	361 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	RIB1	P38066	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	YBR241C	P38142	488 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	SIC1	P38634	284 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	RPP1	P38786	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	YEL057C	P39983	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	REE1	P40893	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	SNM1	P40993	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	RPE1	P46969	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	TOS2	P50078	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	SHE4	P51534	789 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	ATG4	P53867	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	IGO1	P53897	168 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	YSA1	Q01976	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	PLM2	Q04383	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	BUR2	Q05949	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	ENB1	Q08299	606 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	BAG7	Q12128	409 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	COX17	Q12287	69 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	SOD2	P00447	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	STE12	P13574	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	SWH1	P35845	1188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	LHS1	P36016	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	YHR180W	P38868	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	GPI16	P38875	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	SWD1	P39706	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	UBX6	P47049	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	ILM1	P47155	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	PGU1	P47180	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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