RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	SUL1	P38359	859 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	PAC11	P40960	533 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YGR210C	P42942	411 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	PTR3	P43606	678 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YFR057W	P43625	151 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	TRS85	P46944	698 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	NAS6	P50086	228 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	SBH2	P52871	88 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	NBP35	P52920	328 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YGL235W	P53071	178 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	NIF3	P53081	288 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	BIO4	P53630	237 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	BUD17	P53727	317 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	KIN4	Q01919	800 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	RMI1	Q02685	241 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	MSC1	Q03104	513 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	NRG1	Q03125	231 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	RFU1	Q08003	200 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	FRE5	Q08908	694 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	TMS1	Q12116	473 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	SIA1	Q12212	622 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PAM18	YLR008C	COX1	P00401	534 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	COR1	P07256	457 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RPB8	P20436	146 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RAD57	P25301	460 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	PPZ1	P26570	692 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	CLG1	P35190	452 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	YET1	P35723	206 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	MYO3	P36006	1272 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RRN10	P38204	145 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	INM1	P38710	295 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	GAT2	P40209	560 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	ALG8	P40351	577 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	SLM1	P40485	686 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	PCI8	P40512	444 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	COS4	P43542	379 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	SFH5	P47008	294 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	HOC1	P47124	396 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	YTP1	P53584	459 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	YLR460C	P54007	376 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	SMP3	Q04174	516 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	DLT1	Q04216	342 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	SOR2	Q07786	357 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	TEN1	Q07921	160 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	PLB3	Q08108	686 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	TAF10	Q12030	206 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	EMP46	Q12396	444 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	FSH3	Q99369	266 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	SCEI	P03882	235 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	OPI3	P05375	206 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RHO2	P06781	192 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	AMD2	P22580	549 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	PTP1	P25044	335 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	ERG4	P25340	473 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	ITR2	P30606	609 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	TCA17	P32613	152 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	TMT1	P32643	299 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	MBB1	P39534	108 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	UIP3	P39547	235 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	MIC19	P43594	170 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	YFR020W	P43600	232 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	YJR079W	P47126	109 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	ILM1	P47155	203 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	MSY1	P48527	492 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	PMT5	P52867	743 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	SHY1	P53266	389 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	YPR003C	P53394	754 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	CSM3	Q04659	317 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RIF2	Q06208	395 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	NDE2	Q07500	545 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	YLR053C	Q12026	108 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PAM18	YLR008C	RNH203	Q12338	110 aa		3.64	□□□□□ -1.83

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