RNA–Protein interactions for RNA: YKL115C

YKL115C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL115C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL115CYKL115C SPS100P13130 326 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C BGL2P15703 313 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C ACB1P31787 87 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C SUR1P33300 382 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C ECT1P33412 323 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C SMP1P38128 452 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C SHE1P38200 338 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C YER184CP39961 794 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C HIT1P46973 164 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C TAF6P53040 516 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C FLC3P53121 802 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C NRM1P53718 249 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C MRX11Q03079 207 aa2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C RPN8Q08723 338 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YKL115CYKL115C STE2D6VTK4 431 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C GAL3P13045 520 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C MEI5P32489 222 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C DTR1P38125 572 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C CHL4P38907 458 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C RMI1Q02685 241 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YLR297WQ05899 129 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C MMT2Q08970 484 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C TAF10Q12030 206 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YBL111CQ3E7Y5 667 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C PET18P25362 215 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C MMS21P38632 267 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C GGC1P38988 300 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C FHL1P39521 936 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C SSO2P39926 295 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YGR168CP53293 376 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C TPI1P00942 248 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C PUT4P15380 627 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C ZIP1P31111 875 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YPS1P32329 569 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C RAD23P32628 398 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C END3P39013 349 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YFR018CP43599 363 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C TPC1P53257 314 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C RAX2Q12465 1220 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YDL012CQ12489 107 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C MHP1P43638 1398 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C GCD2P12754 651 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YKL162CP36052 402 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YDR089WP38966 869 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C UTP25P40498 721 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C SED5Q01590 340 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C VPS20Q04272 221 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C API2Q04413 109 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C PRM4Q12498 284 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C CKA2P19454 339 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C RRT13P40042 185 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C COQ5P49017 307 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C RNY1Q02933 434 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C IRC4Q03036 179 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C FAR10Q06001 478 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C FLO11P08640 1367 aa2.48□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C CBP2P03874 630 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C BUD2P33314 1104 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C TIP20P33891 701 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C SWC5P38326 303 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C CTM1P38818 585 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C FET3P38993 636 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C PES4P39684 611 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C INA22P40576 216 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C LOH1P47055 219 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YGR067CP53243 804 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C VOA1P53262 265 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C CAB5Q03941 241 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C CUR1Q06469 252 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C PAA1Q12447 191 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YPR1Q12458 312 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C YOL085CQ99345 113 aa2.47□□□□□ -2.01
YKL115CYKL115C REP1P03871 373 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C SAR1P20606 190 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.46□□□□□ -2.02not detected
YKL115CYKL115C TAE1P38340 232 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C ARP5P53946 755 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C MRX8Q05473 314 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C MIM1Q08176 113 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C YOL029CQ08187 201 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C MDY2Q12285 212 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C YAL067W-AQ8TGK6 75 aa2.46□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C ZRT1P32804 376 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C YKL187CP34231 750 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C YHR035WP38769 630 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C PET8P38921 284 aa2.45□□□□□ -2.02
YKL115CYKL115C DSE1P40077 573 aa2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 184.6 ms