RNA–Protein interactions for RNA: YBR103W

SIF2, Transcript of WD40 repeat-containing subunit of Set3C histone deacetylase complex, yeast

Gene SIF2, Length 1,608 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIF2	YBR103W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	OAR1	P35731	278 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SRX1	P36077	127 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	GPX2	P38143	162 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YHK8	P38776	514 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	NSG1	P38837	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YHR182W	P38870	785 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PEX7	P39108	375 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RGI2	P40188	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PAN6	P40459	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	JAC1	P53193	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SWC4	P53201	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	POP6	P53218	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YGR042W	P53227	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	VOA1	P53262	265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CDC14	Q00684	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	BOP2	Q06150	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
SIF2	YBR103W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RAD7	P06779	565 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	EMC1	P25574	760 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	AEP1	P32493	518 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CTF13	P35203	478 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YEL020C	P39994	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SCC4	P40090	624 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	BUD8	P41698	603 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	BIO3	P50277	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	EMC4	P53073	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	BIO4	P53630	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CPR8	P53728	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	AQR1	P53943	586 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	OCA2	P53949	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PRM15	Q03262	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RCO1	Q04779	684 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	IRA2	P19158	3079 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	HTB2	P02294	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	UGA1	P17649	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CDC50	P25656	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MGT1	P26188	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	LDS1	P31379	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PDC2	P32896	925 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	KAE1	P36132	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SHG1	P38337	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PFS1	P38872	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PCL7	P40186	285 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SWM2	P40342	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PGD1	P40356	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	IDP2	P41939	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ZIM17	P42844	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	LOH1	P47055	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	COS12	P53053	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	COG7	P53195	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	COX18	P53239	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TVP15	Q03860	143 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	HOF1	Q05080	669 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ASR1	Q06834	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ATX2	Q12067	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SPC3	Q12133	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TRM10	Q12400	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ISN1	Q99312	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	BAR1	P12630	587 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	UTR1	P21373	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SEC62	P21825	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	POF1	P25576	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CSM1	P25651	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ATP11	P32453	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	SSS1	P35179	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PHO11	P35842	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	CTP1	P38152	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	PHO12	P38693	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	LAG1	P38703	411 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SIF2	YBR103W	ARN2	P38724	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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