RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 RASGRF2O14827 1237 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 CUL1Q13616 776 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NAA25Q14CX7 972 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TMED2Q15363 201 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 MMP19Q99542 508 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 REEP2Q9BRK0 252 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 MST1RQ04912 1400 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TNFAIP2Q03169 654 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ALS2CLQ60I27 953 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PDXDC1Q6P996 788 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 MSH2P43246 934 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 LIG3P49916 1009 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS6KA2Q15349 733 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 POLLQ9UGP5 575 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SMARCA1P28370 1054 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 STYK1Q6J9G0 422 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PPLO60437 1756 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBED1O96006 694 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 GPC3P51654 580 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 CASP7P55210 303 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NXNQ6DKJ4 435 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PDIK1LQ8N165 341 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 HSPH1Q92598 858 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SUN1O94901 812 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ECE1P42892 770 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR24Q96S15 920 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NR3C2P08235 984 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 STAT5BP51692 787 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 GPD1LQ8N335 351 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 DCCP43146 1447 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSL3O95573 720 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 PODXLO00592 558 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 BBS5Q8N3I7 341 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ELP3Q9H9T3 547 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 EFCC1Q9HA90 598 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ESYT2A0FGR8 921 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TJP3O95049 919 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 IFT88Q13099 833 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NFIAQ12857 509 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SRGNP10124 158 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 EPC1Q9H2F5 836 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 CCZ1BP86790 482 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NUP85Q9BW27 656 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 GSTA1P08263 222 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 GSTA2P09210 222 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 GNAT1P11488 350 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 DPEP1P16444 411 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NR1D1P20393 614 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 GNA15P30679 374 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 SOX5P35711 763 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 NR1I3Q14994 352 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF149Q8NC42 400 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC197Q8NCU1 140 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF139Q8WU17 664 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms