RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF862O60290 1169 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 STBD1O95210 358 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ACTN1P12814 892 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 VEGFBP49765 207 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 NOGQ13253 232 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PPIL2Q13356 520 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 STXBP2Q15833 593 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.96□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CEP112Q8N8E3 955 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SIX2Q9NPC8 291 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GCNT4Q9P109 453 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GABBR1Q9UBS5 961 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ANO9A1A5B4 782 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CXCL11O14625 94 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 EXOC3O60645 756 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 CYP2J2P51589 502 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PEX3P56589 373 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ACTR2P61160 394 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SNAPC2Q13487 334 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ASIC2Q16515 512 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 FAM133AQ8N9E0 248 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MCM3APO60318 1980 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 AOC2O75106 756 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEA1P43355 309 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GTF2A2P52657 109 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 JAM2P57087 298 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CNTN2Q02246 1040 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 BFSP1Q12934 665 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SLC18A3Q16572 532 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA1Q92805 767 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 KIFAP3Q92845 792 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 HVCN1Q96D96 273 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MAPK13O15264 365 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SLC16A4O15374 487 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 DGAT1O75907 488 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ATG7O95352 703 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 EDNRBP24530 442 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PRKCIP41743 596 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CHMP4BP1P59074 171 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SP2Q02086 613 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 CEP170P1Q96L14 293 aa8.94□□□□□ -0.98
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PDE4D-208ENST00000502484 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ENC1O14682 589 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 PEX10O60683 326 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CNMDO75829 334 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 CETPP11597 493 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 NPTX2P47972 431 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 SMTNP53814 917 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 RTP1P59025 263 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-208ENST00000502484 TUBB4BP68371 445 aa8.94□□□□□ -0.98
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