RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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NISCH-212ENST00000488380 SMIM24O75264 130 aa14.58□□□□□ -0.08
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NISCH-212ENST00000488380 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.58□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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NISCH-212ENST00000488380 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.57□□□□□ -0.08
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NISCH-212ENST00000488380 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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NISCH-212ENST00000488380 CCDC188H7C350 402 aa14.57□□□□□ -0.08
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NISCH-212ENST00000488380 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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NISCH-212ENST00000488380 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.56□□□□□ -0.08
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NISCH-212ENST00000488380 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.56□□□□□ -0.08
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NISCH-212ENST00000488380 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.56□□□□□ -0.08
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NISCH-212ENST00000488380 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 HLA-DOAP06340 250 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 PDE6CP51160 858 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 JAG1P78504 1218 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 LRRC63Q05C16 580 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NISCH-212ENST00000488380 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.55□□□□□ -0.08
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