RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 P4HBP07237 508 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMA2P25787 234 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF667Q5HYK9 610 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH2D4BQ5SQS7 431 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF449Q6P9G9 518 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SP8Q8IXZ3 490 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EMSYQ7Z589 1322 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYMKA6NI61 221 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARL4AP40617 200 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AMACRQ9UHK6 382 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASA1P20936 1047 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSDMBQ8TAX9 411 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XPOTO43592 962 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM81BQ96LP2 452 aa17.79■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCSK1NQ9UHG2 260 aa17.79■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCGF5Q86SE9 256 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR6B3Q8NGW1 331 aa17.78■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYCP01106 439 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NWD1Q149M9 1564 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK6Q16659 721 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MS4A14Q96JA4 679 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC1Q9BTT6 524 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED7O43513 233 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPC4O75487 556 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSPG5O95196 566 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP11P51784 963 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JAK3P52333 1124 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLFN12LQ6IEE8 588 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R18Q6NYC8 613 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HAUS6Q7Z4H7 955 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFCAB13Q8IY85 973 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa17.78■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBED1O96006 694 aa17.77■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NR1I3Q14994 352 aa17.77■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VCXQ9H320 206 aa17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SART1O43290 800 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STXBP2Q15833 593 aa17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDXDC1Q6P996 788 aa17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIM2Q9P1W9 311 aa17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINB6P35237 376 aa17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM35BQ8NCS4 154 aa17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP36Q96G28 342 aa17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FIS1Q9Y3D6 152 aa17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEY1Q9Y5J3 304 aa17.77■□□□□ 0.44
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASP7P55210 303 aa17.77■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CATSPER4Q7RTX7 472 aa17.77■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.43
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUP85Q9BW27 656 aa17.77■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMEP08473 750 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OSBPP22059 807 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO1EQ12965 1108 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AP5M1Q9H0R1 490 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FEM1BQ9UK73 627 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCL9O00512 1426 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOM1L1O75674 476 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLK7P49862 253 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO1CO00159 1063 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OATP04181 439 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GYPCP04921 128 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX19P40855 299 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARPP19P56211 112 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SBK1Q52WX2 424 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PODXLO00592 558 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDHBP11177 359 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDIA5Q14554 519 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C6orf118Q5T5N4 469 aa17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR70Q9NW82 654 aa17.76■□□□□ 0.43
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