RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461405.1

PHF20-208, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 2

Gene PHF20, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-208	ENST00000461405	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	DHX58	Q96C10	678 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	FGFR4	P22455	802 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	CMA1	P23946	247 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	SHH	Q15465	462 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	MYMK	A6NI61	221 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	MGEA5	O60502	916 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	EDN1	P05305	212 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	NDUFA8	P51970	172 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	GIT2	Q14161	759 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	AMHR2	Q16671	573 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	KCND2	Q9NZV8	630 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	MYH11	P35749	1972 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	GBF1	Q92538	1859 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	ASAP2	O43150	1006 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	FGB	P02675	491 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	NAMPT	P43490	491 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	ZNF131	P52739	623 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	PTEN	P60484	403 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	DEFB103A	P81534	67 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	PAK2	Q13177	524 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	DSC3	Q14574	896 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	SEPT8	Q92599	483 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	STAM	Q92783	540 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	FIZ1	Q96SL8	496 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	CASP1	P29466	404 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	PHKA2	P46019	1235 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	NPTX2	P47972	431 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	TFDP1	Q14186	410 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	DDX12P	Q92771	950 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	APBB2	Q92870	758 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PHF20-208	ENST00000461405	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.41	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms