RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 ARHGEF35A5YM69 484 aa16.94■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 CAP2P40123 477 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 MYL7Q01449 175 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 PPP3CAQ08209 521 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 SLFN11Q7Z7L1 901 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.94■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 LMO3Q8TAP4 145 aa16.94■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.94■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 CCPG1Q9ULG6 757 aa16.94■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 ZNF341Q9BYN7 854 aa16.93■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 FERP16591 822 aa16.93■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 C10orf76Q5T2E6 689 aa16.93■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 STRA6Q9BX79 667 aa16.93■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.93■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 EMSYQ7Z589 1322 aa16.93■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 ALS2CLQ60I27 953 aa16.92■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.92■□□□□ 0.31e-7■□□□□ 10.6
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NISCH-202ENST00000420808 TELO2Q9Y4R8 837 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 PPFIA4O75335 1185 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 SOX10P56693 466 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 PPFIA1Q13136 1202 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 STK24Q9Y6E0 443 aa16.92■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 OPA1O60313 960 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 ATP9AO75110 1047 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 FGGP02679 453 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 ALAS1P13196 640 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 MARCKSL1P49006 195 aa16.91■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 HES6Q96HZ4 224 aa16.91■□□□□ 0.3
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NISCH-202ENST00000420808 WNK4Q96J92 1243 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 PBKQ96KB5 322 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 CENPHQ9H3R5 247 aa16.91■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 HSD17B3P37058 310 aa16.9■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 PTGER2P43116 358 aa16.9■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 PPATQ06203 517 aa16.9■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.9■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 ALG3Q92685 438 aa16.9■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 TAAR1Q96RJ0 339 aa16.9■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 ISCUQ9H1K1 167 aa16.9■□□□□ 0.3
NISCH-202ENST00000420808 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.9■□□□□ 0.3
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