RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU2-38P-201ENST00000410856 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU2-38P-201ENST00000410856 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU2-38P-201ENST00000410856 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU2-38P-201ENST00000410856 MYADML2A6NDP7 307 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 GOLGA6L22H0YM25 854 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 IKBKBO14920 756 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 HIP1RO75146 1068 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPEPPSP55786 919 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAPK7Q13164 816 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SEC23AQ15436 765 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 DDR2Q16832 855 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 METTL24Q5JXM2 366 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAVIN3Q969G5 261 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 BRIP1Q9BX63 1249 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 NCDNQ9UBB6 729 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 DAPK3O43293 454 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 HKR1P10072 659 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 HK1P19367 917 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CXCR5P32302 372 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ETFBP38117 255 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNM2P50570 870 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 BLOC1S1P78537 153 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC62Q6P9F0 684 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLEC14AQ86T13 490 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CMTM4Q8IZR5 234 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNH6Q9H252 994 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 RASSF10A6NK89 507 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 MTSS1O43312 755 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ROM1Q03395 351 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 LRP10Q7Z4F1 713 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC9A6Q92581 669 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 WDR92Q96MX6 357 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDCD2LQ9BRP1 358 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 WDR11Q9BZH6 1224 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF408Q9H9D4 720 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ST7Q9NRC1 585 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SYBUQ9NX95 663 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCMF1Q9P0J7 381 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNF7Q9UBF6 113 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 GAGE12BA1L429 117 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 GAGE12HA6NDE8 117 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 NRP1O14786 923 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF185O15231 689 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 LPXNO60711 386 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRLP01236 227 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SEC24CP53992 1094 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 TM4SF20Q53R12 229 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 DYDC2Q96IM9 177 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC12A8A0AV02 714 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIR2DL3P43628 341 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 FNTBP49356 437 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 GABREP78334 506 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CATSPEREQ5SY80 951 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms