RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CDK17Q00537 523 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MESP2Q0VG99 397 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ADRM1Q16186 407 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GAREM2Q75VX8 874 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 AIFM3Q96NN9 605 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CSRNP2Q9H175 543 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO10Q9UK96 956 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 IRAK3Q9Y616 596 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0G2JNJ9 132 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 NRP2O60462 931 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 LPOP22079 712 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 AKAP5P24588 427 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ANTXR2P58335 489 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MALLQ13021 153 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GTF2H3Q13889 308 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MCTP1Q6DN14 999 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MIER2Q8N344 545 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 DYDC2Q96IM9 177 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SOX7Q9BT81 388 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ANLNQ9NQW6 1124 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 Q9UFV3 132 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SCOCQ9UIL1 159 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SERPINB13Q9UIV8 391 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 KLHL18O94889 574 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 KRT1P04264 644 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 PI3P19957 117 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRC-205ENST00000391970 POLD1P28340 1107 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRC-205ENST00000391970 SLC16A1P53985 500 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 NRG3P56975 720 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 CAP1Q01518 475 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 SSPNQ14714 243 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 VWA3BQ502W6 1294 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 BTNL9Q6UXG8 535 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 SAPCD2Q86UD0 394 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 PPM1NQ8N819 430 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 FATE1Q969F0 183 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 COA7Q96BR5 231 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 LRGUKQ96M69 825 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRC-205ENST00000391970 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 DNAI1Q9UI46 699 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 VSTM5A8MXK1 200 aa4.07□□□□□ -1.76
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PTPRC-205ENST00000391970 TMEM127O75204 238 aa4.07□□□□□ -1.76
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PTPRC-205ENST00000391970 UAP1L1Q3KQV9 507 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-205ENST00000391970 LILRA6Q6PI73 481 aa4.07□□□□□ -1.76
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