RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHADLQ6NUI6 762 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARMCX2Q7L311 632 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR20Q99678 358 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIP14410 1827 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC169A6NNP5 214 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 H0YCG3 227 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAPK13O15264 365 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFC5P40937 340 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCFD2Q8WU76 684 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM167AQ96KS9 214 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.92■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC3O60645 756 aa23.92■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTLL4Q14679 1199 aa23.92■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDXDC1Q6P996 788 aa23.92■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.92■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFT74Q96LB3 600 aa23.92■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GANQ9H2C0 597 aa23.92■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.92■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMSYQ7Z589 1322 aa23.92■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DENND3A2RUS2 1198 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOX10P56693 466 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HUNKP57058 714 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF592Q92610 1267 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AZI2Q9H6S1 392 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VTA1Q9NP79 307 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC53A6NM62 1247 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GBP6Q6ZN66 633 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRAGAQ7L523 313 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXL5Q9UKA1 691 aa23.91■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DYNC1I1O14576 645 aa23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BFSP1Q12934 665 aa23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRB14Q14449 540 aa23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR142Q7Z601 462 aa23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XXYLT1Q8NBI6 393 aa23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CBWD1Q9BRT8 395 aa23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSPBP1Q9NZL4 362 aa23.9■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.89■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PON1P27169 355 aa23.89■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAPK4P31152 587 aa23.89■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.89■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA33Q96N06 139 aa23.89■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TISP43B9A030 160 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARL2P36404 184 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FMO5P49326 533 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC26A2P50443 739 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAMPTP43490 491 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT83P78385 493 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYO6Q9UM54 1294 aa23.88■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.87■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT13P13646 458 aa23.87■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC9A1P19634 815 aa23.87■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNGA1P29973 690 aa23.87■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADSSP30520 456 aa23.87■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.87■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.87■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KATNBL1Q9H079 304 aa23.87■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.87■■□□□ 1.41
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCNT4Q9P109 453 aa23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms