RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 CALML4Q96GE6 196 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TMX1Q9H3N1 280 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 COL4A6Q14031 1691 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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PTX4-201ENST00000293922 GPR32O75388 356 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 MED24O75448 989 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 MUTP22033 750 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 E2F4Q16254 413 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 PNMA5Q96PV4 448 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 DACT1Q9NYF0 836 aa20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TMEM150BA6NC51 233 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TRAK2O60296 914 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 SLITRK3O94933 977 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 ZNF202O95125 648 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 XKR3Q5GH77 459 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 PDILTQ8N807 584 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 BANK1Q8NDB2 785 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 CEP89Q96ST8 783 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 OSMRQ99650 979 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 RGL1Q9NZL6 768 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 EVPLQ92817 2033 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TTC28Q96AY4 2481 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TTC3P53804 2025 aa20.29■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 RPS6KA5O75582 802 aa20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 PLCG1P19174 1290 aa20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 ECM1Q16610 540 aa20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 IQUBQ8NA54 791 aa20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 DYDC2Q96IM9 177 aa20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TIGD1Q96MW7 591 aa20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 PANK2Q9BZ23 570 aa20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 USP25Q9UHP3 1055 aa20.28■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 DLL1O00548 723 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 MGEA5O60502 916 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 KINO60870 393 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TMOD1P28289 359 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 PSMC5P62195 406 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 CYP4A11Q02928 519 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 EPC2Q52LR7 807 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 DHX58Q96C10 678 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 MAP7D2Q96T17 732 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 AKT3Q9Y243 479 aa20.27■□□□□ 0.84
PTX4-201ENST00000293922 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTX4-201ENST00000293922 LYPLA2O95372 231 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 LINC00271P0C7V0 271 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 STAT6P42226 847 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 LONRF3Q496Y0 759 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 MTERF2Q49AM1 385 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 ANO5Q75V66 913 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 FAM228AQ86W67 206 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 LRRC15Q8TF66 581 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 SAMD11Q96NU1 681 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 LXNQ9BS40 222 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 CUEDC2Q9H467 287 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.27■□□□□ 0.83
PTX4-201ENST00000293922 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
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