RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624444.1

CU633967.1-211, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CU633967.1, Length 7,628 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-211ENST00000624444 NFKBIBQ15653 356 aa7.36□□□□□ -1.23
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CU633967.1-211ENST00000624444 MCTP1Q6DN14 999 aa7.36□□□□□ -1.23
CU633967.1-211ENST00000624444 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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CU633967.1-211ENST00000624444 HOMER1Q86YM7 354 aa7.32□□□□□ -1.24
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CU633967.1-211ENST00000624444 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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CU633967.1-211ENST00000624444 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
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CU633967.1-211ENST00000624444 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.29□□□□□ -1.24
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CU633967.1-211ENST00000624444 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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CU633967.1-211ENST00000624444 CCDC27Q2M243 656 aa7.29□□□□□ -1.24
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CU633967.1-211ENST00000624444 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.25□□□□□ -1.25
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CU633967.1-211ENST00000624444 APAF1O14727 1248 aa7.25□□□□□ -1.25
CU633967.1-211ENST00000624444 PDE3BQ13370 1112 aa7.25□□□□□ -1.25
CU633967.1-211ENST00000624444 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.25□□□□□ -1.25
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CU633967.1-211ENST00000624444 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.25□□□□□ -1.25
CU633967.1-211ENST00000624444 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CU633967.1-211ENST00000624444 MRE11P49959 708 aa7.25□□□□□ -1.25
CU633967.1-211ENST00000624444 TPM2P07951 284 aa7.25□□□□□ -1.25
CU633967.1-211ENST00000624444 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CU633967.1-211ENST00000624444 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.25□□□□□ -1.25
CU633967.1-211ENST00000624444 MAP7D2Q96T17 732 aa7.25□□□□□ -1.25
CU633967.1-211ENST00000624444 LNPKQ9C0E8 428 aa7.25□□□□□ -1.25
CU633967.1-211ENST00000624444 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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