RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187372.1

Gm28725-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm28725, Length 622 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Rccd1Q8BTU7 377 aa11.61□□□□□ -0.55
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Mink1Q9JM52 1308 aa11.6□□□□□ -0.55
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Prpmp5E9PXN1 296 aa11.6□□□□□ -0.55
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Fam117aQ7TNF9 451 aa11.6□□□□□ -0.55
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Rgs9O54828 675 aa11.59□□□□□ -0.55
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Fchsd2Q3USJ8 740 aa11.59□□□□□ -0.55
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Clcn1Q64347 994 aa11.59□□□□□ -0.55
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Kcnc4Q8R1C0 628 aa11.59□□□□□ -0.55
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Mre11Q61216 706 aa11.58□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Fam221bQ8C627 487 aa11.58□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Slc27a5Q4LDG0 689 aa11.57□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Fam160a1Q505K2 1081 aa11.57□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Kctd12Q6WVG3 327 aa11.57□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Map2k7Q8CE90 535 aa11.57□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Nob1Q8BW10 403 aa11.56□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Itgbl1Q8VDV0 494 aa11.55□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 A930017K11RikE0CXQ2 571 aa11.54□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Wdr44Q6NVE8 915 aa11.54□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Ggt6Q6PDE7 497 aa11.54□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Hic1Q9R1Y5 733 aa11.54□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Map2k5Q9WVS7 448 aa11.54□□□□□ -0.56
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Itga6Q61739 1091 aa11.52□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Gpr37Q9QY42 600 aa11.52□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Q9CQ90 155 aa11.51□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Uri1Q3TLD5 531 aa11.5□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 GopcQ8BH60 463 aa11.5□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Trim32Q8CH72 655 aa11.5□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Chst12Q99LL3 419 aa11.5□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Large2Q5XPT3 690 aa11.47□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 OplahQ8K010 1288 aa11.47□□□□□ -0.57
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Rbm46P86049 533 aa11.45□□□□□ -0.58
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
Gm28725-201ENSMUST00000187372 NntQ61941 1086 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
Gm28725-201ENSMUST00000187372 PrimpolQ6P1E7 537 aa11.44□□□□□ -0.58
Gm28725-201ENSMUST00000187372 TsksO54887 585 aa11.42□□□□□ -0.58
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Tie1Q06806 1134 aa11.41□□□□□ -0.58
Gm28725-201ENSMUST00000187372 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Ano8Q6PB70 1060 aa11.4□□□□□ -0.58
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Caskin2Q8VHK1 1201 aa11.37□□□□□ -0.59
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Wbp1lQ8BGW2 348 aa11.36□□□□□ -0.59
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Irf5P56477 497 aa11.35□□□□□ -0.59
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Ppp4cP97470 307 aa11.34□□□□□ -0.59
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Fam193bQ3U2K0 892 aa11.34□□□□□ -0.59
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Rnf40Q3U319 1001 aa11.34□□□□□ -0.59
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Gimap6Q8K349 305 aa11.33□□□□□ -0.6
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Cyp8b1O88962 500 aa11.31□□□□□ -0.6
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Klra1P20937 262 aa11.31□□□□□ -0.6
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Kcnn2P58390 839 aa11.3□□□□□ -0.6
Gm28725-201ENSMUST00000187372 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Saxo1B1AXP3 476 aa11.29□□□□□ -0.6
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Ankrd34aB2RW11 495 aa11.28□□□□□ -0.6
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Sulf1Q8K007 870 aa11.28□□□□□ -0.6
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Dph2Q9CR25 489 aa11.28□□□□□ -0.6
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Phox2bO35690 314 aa11.27□□□□□ -0.61
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Jph1Q9ET80 660 aa11.26□□□□□ -0.61
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Gm11563B1AQ90 168 aa11.25□□□□□ -0.61
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Znf423Q80TS5 1292 aa11.25□□□□□ -0.61
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Krtap4-7Q9D732 168 aa11.25□□□□□ -0.61
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Emp3O35912 163 aa11.24□□□□□ -0.61
Gm28725-201ENSMUST00000187372 OatP29758 439 aa11.24□□□□□ -0.61
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Pcmtd1P59913 357 aa11.24□□□□□ -0.61
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Ufsp1Q9CZP0 217 aa11.24□□□□□ -0.61
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Spata31d1aE9QA35 1336 aa11.19□□□□□ -0.62
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Nos2P29477 1144 aa11.19□□□□□ -0.62
Gm28725-201ENSMUST00000187372 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Hmx2P43687 273 aa11.16□□□□□ -0.62
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Tmub1Q9JMG3 245 aa11.16□□□□□ -0.62
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Vars2Q3U2A8 1060 aa11.15□□□□□ -0.62
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Map3k9Q3U1V8 1077 aa11.14□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Scube2Q9JJS0 997 aa11.14□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Atf4Q06507 349 aa11.12□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Scube3Q66PY1 993 aa11.12□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Themis2Q91YX0 663 aa11.12□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 MsmpB1AWI6 139 aa11.11□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Vsig10D3YX43 558 aa11.11□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Wfs1P56695 890 aa11.11□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Krtap3-2Q9D638 99 aa11.11□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa11.11□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Speer3W4VSP1 261 aa11.11□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Tsen34Q8BMZ5 316 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Znf330Q922H9 316 aa11.1□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Cops2P61202 443 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 FcrlaQ920A9 352 aa11.09□□□□□ -0.63
Gm28725-201ENSMUST00000187372 AaasP58742 546 aa11.07□□□□□ -0.64
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Pola2P33611 600 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Sirt1Q923E4 737 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Spaca7Q9D2S4 182 aa11.06□□□□□ -0.64
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Gm11555B1AQ89 175 aa11.05□□□□□ -0.64
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm28725-201ENSMUST00000187372 PtpreP49446 699 aa11.04□□□□□ -0.64
Gm28725-201ENSMUST00000187372 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.9 ms