RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000178728.1

Gm3005-202, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Gm3005, Length 1,955 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Prdm16A2A935 1275 aa21.77■■□□□ 1.08
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Trpm2Q91YD4 1506 aa21.77■■□□□ 1.08
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Uggt2E9Q4X2 1504 aa21.76■■□□□ 1.07
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa21.76■■□□□ 1.07
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Kif3bQ61771 747 aa21.76■■□□□ 1.07
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa21.74■■□□□ 1.07
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Plch2A2AP18 1501 aa21.73■■□□□ 1.07
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Topaz1E5FYH1 1653 aa21.73■■□□□ 1.07
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ssh2Q5SW75 1423 aa21.72■■□□□ 1.07
Gm3005-202ENSMUST00000178728 UacaQ8CGB3 1411 aa21.72■■□□□ 1.07
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa21.72■■□□□ 1.07
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Scn4aQ9ER60 1841 aa21.7■■□□□ 1.06
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Myo5cE9Q1F5 1742 aa21.7■■□□□ 1.06
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Knl1Q66JQ7 1612 aa21.69■■□□□ 1.06
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Naip5Q9R016 1403 aa21.68■■□□□ 1.06
Gm3005-202ENSMUST00000178728 ShprhQ7TPQ3 1674 aa21.67■■□□□ 1.06
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Rfx7F8VPJ6 1459 aa21.66■■□□□ 1.06
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Zfp644E9QA22 1323 aa21.66■■□□□ 1.06
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa21.62■■□□□ 1.05
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Prex1Q69ZK0 1650 aa21.62■■□□□ 1.05
Gm3005-202ENSMUST00000178728 NclP09405 707 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
Gm3005-202ENSMUST00000178728 AlkP97793 1621 aa21.6■■□□□ 1.05
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Mia2Q91ZV0 1396 aa21.59■■□□□ 1.05
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Vps8Q0P5W1 1427 aa21.59■■□□□ 1.05
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Fhad1A6PWD2 1420 aa21.57■■□□□ 1.04
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Dip2aQ8BWT5 1523 aa21.57■■□□□ 1.04
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Bcl9Q9D219 1425 aa21.52■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Gm13697A2AK42 830 aa21.51■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ube2uB1AUC4 352 aa21.51■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Pde4cQ3UEI1 686 aa21.51■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Mier1Q5UAK0 511 aa21.5■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Adamts7Q68SA9 1657 aa21.5■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Asxl1P59598 1514 aa21.5■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Rsph4aQ8BYM7 716 aa21.48■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Robo2Q7TPD3 1470 aa21.48■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Abcc6Q9R1S7 1498 aa21.48■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Map4P27546 1125 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Hfm1D3Z4R1 1434 aa21.47■■□□□ 1.03
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ttll5Q8CHB8 1328 aa21.45■■□□□ 1.02
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Akap12Q9WTQ5 1684 aa21.45■■□□□ 1.02
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa21.43■■□□□ 1.02
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa21.43■■□□□ 1.02
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa21.42■■□□□ 1.02
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Pip4k2bQ80XI4 416 aa21.41■■□□□ 1.02
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa21.41■■□□□ 1.02
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa21.38■■□□□ 1.01
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Clstn2Q9ER65 966 aa21.37■■□□□ 1.01
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ncoa1P70365 1447 aa21.37■■□□□ 1.01
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Trak1Q6PD31 939 aa21.35■■□□□ 1.01
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Kif13aQ9EQW7 1749 aa21.35■■□□□ 1.01
Gm3005-202ENSMUST00000178728 AnkarA2RT91 1465 aa21.33■■□□□ 1.01
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Mphosph9A6H5Y1 991 aa21.33■■□□□ 1.01
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Cd109Q8R422 1442 aa21.31■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ttc21bQ0HA38 1315 aa21.31■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Myom3A2ABU4 1439 aa21.3■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Rims2Q9EQZ7 1530 aa21.3■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 PtprgQ05909 1442 aa21.3■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ino80Q6ZPV2 1559 aa21.29■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa21.29■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa21.27■■□□□ 1
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Skint5A7XUY5 1461 aa21.24■□□□□ 0.99
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Iqgap3F8VQ29 1632 aa21.23■□□□□ 0.99
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Kif21bQ9QXL1 1668 aa21.23■□□□□ 0.99
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Atp7aQ64430 1491 aa21.23■□□□□ 0.99
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Nsd2Q8BVE8 1365 aa21.23■□□□□ 0.99
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Eid3Q3V124 375 aa21.21■□□□□ 0.99
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Gli3Q61602 1583 aa21.21■□□□□ 0.99
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Erich6D3Z6S9 713 aa21.19■□□□□ 0.98
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ccer2J3QPU5 274 aa21.19■□□□□ 0.98
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Pkd2O35245 966 aa21.17■□□□□ 0.98
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Tarbp1E9Q368 1579 aa21.15■□□□□ 0.98
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa21.15■□□□□ 0.98
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Efcab6Q6P1E8 1516 aa21.14■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa21.14■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Naip7Q9JIB3 1402 aa21.14■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Fbxo41Q6NS60 873 aa21.14■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Tecpr2Q3UH45 1423 aa21.13■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Sall3Q62255 1320 aa21.13■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Stk24Q99KH8 431 aa21.1■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Uggt1Q6P5E4 1551 aa21.1■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa21.1■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Rapgef3Q8VCC8 918 aa21.1■□□□□ 0.97
Gm3005-202ENSMUST00000178728 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.7 ms