RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000024978.6

Nme3-201, Transcript of Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nme3, Length 715 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ssh2Q5SW75 1423 aa25.16■■□□□ 1.62
Nme3-201ENSMUST00000024978 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa25.16■■□□□ 1.62
Nme3-201ENSMUST00000024978 Clstn2Q9ER65 966 aa25.16■■□□□ 1.62
Nme3-201ENSMUST00000024978 Gm13697A2AK42 830 aa25.15■■□□□ 1.62
Nme3-201ENSMUST00000024978 Cul9Q80TT8 1865 aa25.14■■□□□ 1.61
Nme3-201ENSMUST00000024978 Uggt2E9Q4X2 1504 aa25.12■■□□□ 1.61
Nme3-201ENSMUST00000024978 Naip5Q9R016 1403 aa25.12■■□□□ 1.61
Nme3-201ENSMUST00000024978 Rfx7F8VPJ6 1459 aa25.11■■□□□ 1.61
Nme3-201ENSMUST00000024978 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa25.1■■□□□ 1.61
Nme3-201ENSMUST00000024978 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
Nme3-201ENSMUST00000024978 Abca6Q8K441 1624 aa25.09■■□□□ 1.61
Nme3-201ENSMUST00000024978 Pde4cQ3UEI1 686 aa25.09■■□□□ 1.61
Nme3-201ENSMUST00000024978 Mia2Q91ZV0 1396 aa25.08■■□□□ 1.61
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ube2uB1AUC4 352 aa25.08■■□□□ 1.61
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
Nme3-201ENSMUST00000024978 Vps8Q0P5W1 1427 aa25.07■■□□□ 1.6
Nme3-201ENSMUST00000024978 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Nme3-201ENSMUST00000024978 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
Nme3-201ENSMUST00000024978 Map4P27546 1125 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Nme3-201ENSMUST00000024978 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
Nme3-201ENSMUST00000024978 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa25■■□□□ 1.59
Nme3-201ENSMUST00000024978 Abca17E9PX95 1733 aa24.98■■□□□ 1.59
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
Nme3-201ENSMUST00000024978 Bcl9Q9D219 1425 aa24.97■■□□□ 1.59
Nme3-201ENSMUST00000024978 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Nme3-201ENSMUST00000024978 Knl1Q66JQ7 1612 aa24.97■■□□□ 1.59
Nme3-201ENSMUST00000024978 Hfm1D3Z4R1 1434 aa24.95■■□□□ 1.58
Nme3-201ENSMUST00000024978 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Nme3-201ENSMUST00000024978 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
Nme3-201ENSMUST00000024978 Dip2bQ3UH60 1574 aa24.93■■□□□ 1.58
Nme3-201ENSMUST00000024978 Fhad1A6PWD2 1420 aa24.9■■□□□ 1.58
Nme3-201ENSMUST00000024978 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa24.89■■□□□ 1.58
Nme3-201ENSMUST00000024978 Zfp644E9QA22 1323 aa24.89■■□□□ 1.58
Nme3-201ENSMUST00000024978 ShprhQ7TPQ3 1674 aa24.88■■□□□ 1.57
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ttc21bQ0HA38 1315 aa24.87■■□□□ 1.57
Nme3-201ENSMUST00000024978 RictorQ6QI06 1708 aa24.87■■□□□ 1.57
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Nme3-201ENSMUST00000024978 Nsd2Q8BVE8 1365 aa24.85■■□□□ 1.57
Nme3-201ENSMUST00000024978 Abcc6Q9R1S7 1498 aa24.84■■□□□ 1.57
Nme3-201ENSMUST00000024978 AlkP97793 1621 aa24.83■■□□□ 1.57
Nme3-201ENSMUST00000024978 Myom3A2ABU4 1439 aa24.81■■□□□ 1.56
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ecm2Q5FW85 670 aa24.81■■□□□ 1.56
Nme3-201ENSMUST00000024978 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ttll5Q8CHB8 1328 aa24.81■■□□□ 1.56
Nme3-201ENSMUST00000024978 Adamts7Q68SA9 1657 aa24.8■■□□□ 1.56
Nme3-201ENSMUST00000024978 Prex1Q69ZK0 1650 aa24.77■■□□□ 1.56
Nme3-201ENSMUST00000024978 Myo5cE9Q1F5 1742 aa24.77■■□□□ 1.56
Nme3-201ENSMUST00000024978 Trak1Q6PD31 939 aa24.76■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 Cd109Q8R422 1442 aa24.76■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 Dip2aQ8BWT5 1523 aa24.76■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 Topaz1E5FYH1 1653 aa24.75■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 Pip4k2bQ80XI4 416 aa24.75■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 Robo2Q7TPD3 1470 aa24.75■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 Erich6D3Z6S9 713 aa24.73■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ccer2J3QPU5 274 aa24.73■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 Scn4aQ9ER60 1841 aa24.72■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa24.71■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 AnkarA2RT91 1465 aa24.7■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 PtprgQ05909 1442 aa24.7■■□□□ 1.55
Nme3-201ENSMUST00000024978 Cypt1Q8CH20 168 aa24.69■■□□□ 1.54
Nme3-201ENSMUST00000024978 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Nme3-201ENSMUST00000024978 Mphosph9A6H5Y1 991 aa24.68■■□□□ 1.54
Nme3-201ENSMUST00000024978 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa24.66■■□□□ 1.54
Nme3-201ENSMUST00000024978 Skint5A7XUY5 1461 aa24.64■■□□□ 1.54
Nme3-201ENSMUST00000024978 Asxl1P59598 1514 aa24.64■■□□□ 1.53
Nme3-201ENSMUST00000024978 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ncoa1P70365 1447 aa24.63■■□□□ 1.53
Nme3-201ENSMUST00000024978 Txndc2Q6P902 515 aa24.63■■□□□ 1.53
Nme3-201ENSMUST00000024978 Stk24Q99KH8 431 aa24.62■■□□□ 1.53
Nme3-201ENSMUST00000024978 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa24.62■■□□□ 1.53
Nme3-201ENSMUST00000024978 Akap12Q9WTQ5 1684 aa24.61■■□□□ 1.53
Nme3-201ENSMUST00000024978 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
Nme3-201ENSMUST00000024978 Efcab6Q6P1E8 1516 aa24.56■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 Atp7aQ64430 1491 aa24.56■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 Tecpr2Q3UH45 1423 aa24.55■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa24.55■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 Gm13695A2AK44 830 aa24.55■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 Tarbp1E9Q368 1579 aa24.54■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 ErbinQ80TH2 1402 aa24.54■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 Rapgef3Q8VCC8 918 aa24.54■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 Psme1P97371 249 aa24.53■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 P3h3Q8CG70 732 aa24.53■■□□□ 1.52
Nme3-201ENSMUST00000024978 Rims2Q9EQZ7 1530 aa24.51■■□□□ 1.51
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ino80Q6ZPV2 1559 aa24.5■■□□□ 1.51
Nme3-201ENSMUST00000024978 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa24.5■■□□□ 1.51
Nme3-201ENSMUST00000024978 Pkd2O35245 966 aa24.49■■□□□ 1.51
Nme3-201ENSMUST00000024978 Naip7Q9JIB3 1402 aa24.49■■□□□ 1.51
Nme3-201ENSMUST00000024978 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Nme3-201ENSMUST00000024978 Mier1Q5UAK0 511 aa24.47■■□□□ 1.51
Nme3-201ENSMUST00000024978 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
Nme3-201ENSMUST00000024978 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa24.46■■□□□ 1.51
Nme3-201ENSMUST00000024978 Uggt1Q6P5E4 1551 aa24.45■■□□□ 1.5
Nme3-201ENSMUST00000024978 Iqgap3F8VQ29 1632 aa24.43■■□□□ 1.5
Nme3-201ENSMUST00000024978 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Nme3-201ENSMUST00000024978 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Nme3-201ENSMUST00000024978 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa24.41■■□□□ 1.5
Nme3-201ENSMUST00000024978 Sall3Q62255 1320 aa24.4■■□□□ 1.5
Nme3-201ENSMUST00000024978 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Nme3-201ENSMUST00000024978 GapdhsQ64467 440 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.7 ms