RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W OPY2Q06810 360 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W SLM3Q12093 417 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W TIM22Q12328 207 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W GRX6Q12438 231 aa-0.28□□□□□ -2.45
RDS3YPR094W ARG3P05150 338 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ARO3P14843 370 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SRV2P17555 526 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W PRE7P23724 241 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W EFM1P38732 585 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W OTU2P38747 307 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SMF1P38925 575 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W LCB2P40970 561 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W MIC19P43594 170 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YFR018CP43599 363 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YGL118CP53132 145 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W FMP48P53233 369 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W AQR1P53943 586 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SUR7P54003 302 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W RNH203Q12338 110 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ENT1Q12518 454 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YPL247CQ12523 523 aa-0.29□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W VPS63O13549 108 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W CDC21P06785 304 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YOL162WP0CF19 215 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W RPL12BP0CX54 165 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ASC1P38011 319 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W INM1P38710 295 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W STN1P38960 494 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W GLE2P40066 365 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W VID27P40157 782 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W HUA1P40325 198 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W AYR1P40471 297 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W MOB2P43563 287 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SLM2P53955 656 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ACT1P60010 375 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SKO1Q02100 647 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W DCS1Q06151 350 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YOL019WQ08157 551 aa-0.3□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W CDC7P06243 507 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W HIS3P06633 220 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YOL163WP0CF20 169 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W DAP2P18962 818 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W URA10P30402 227 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ITR2P30606 609 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W MYO3P36006 1272 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W DOA1P36037 715 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W TRM7P38238 310 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YER135CP40082 130 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W COS6P53344 381 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W TRM82Q03774 444 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YMR130WQ04223 302 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YLH47Q06493 454 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YDR056CQ12025 205 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W EMC6Q12431 108 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YOL159C-AQ3E769 90 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W BOL1Q3E793 110 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W UBR2Q07963 1872 aa-0.31□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ARF1P11076 181 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W DPM1P14020 267 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YKR045CP36138 183 aa-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W DSE1P40077 573 aa-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SLM1P40485 686 aa-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W HIT1P46973 164 aa-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W TIM10P87108 93 aa-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ERO1Q03103 563 aa-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ACL4Q03771 387 aa-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W GRH1Q04410 372 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ALE1Q08548 619 aa-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W RUP1Q12242 671 aa-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W PRR2Q12310 699 aa-0.32□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SGA1P08019 549 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W RNA1P11745 407 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W CLC1P17891 233 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SLM5P25345 492 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W RRT12P25381 491 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YCR102CP25608 368 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SAS3P34218 831 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YOR062CP36025 268 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W YKL071WP36086 256 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W BYE1P36106 594 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SMF2P38778 549 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W EPL1P43572 832 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W TOM22P49334 152 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W UFD1P53044 361 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W URC2Q04411 772 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W SPO77Q06134 477 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W CTS2Q06350 511 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W NSE1Q07913 336 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W TAF10Q12030 206 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W MTR10Q99189 972 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W AFI1Q99222 893 aa-0.33□□□□□ -2.46
RDS3YPR094W ISN1Q99312 450 aa-0.33□□□□□ -2.46
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