RNA–Protein interactions for RNA: YML013W

UBX2, Transcript of Bridging factor involved in ER-associated protein degradation (ERAD), yeast

Gene UBX2, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX2	YML013W	MSC2	Q03455	724 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	ARR3	Q06598	404 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YDL057W	Q07379	328 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	SLD7	Q08457	257 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YDR018C	Q12185	396 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	MTR10	Q99189	972 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	SAS5	Q99314	248 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	CDC23	P16522	626 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YCR101C	P25607	182 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	CDC20	P26309	610 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YIM1	P28625	365 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	ARO7	P32178	256 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	AEP1	P32493	518 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	SIP1	P32578	815 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	PTC1	P35182	281 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	POP7	P38291	140 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YHR182W	P38870	785 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.19	□□□□□ -1.58	not detected
UBX2	YML013W	IPT1	P38954	527 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	MRH4	P53166	561 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	IMO32	P53219	342 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	VOA1	P53262	265 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YAT1	P80235	687 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	MAK3	Q03503	176 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	EKI1	Q03764	534 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	CAB5	Q03941	241 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RRG8	Q06109	277 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	GPN3	Q06543	272 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YDL086W	Q07505	273 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	NSL1	Q12143	216 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RIF1	P29539	1916 aa		5.19	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	UBR1	P19812	1950 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	MYO1	P08964	1928 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	APA2	P22108	325 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	PPZ1	P26570	692 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YBR144C	P34215	104 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	FMC1	P40491	155 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RPE1	P46969	238 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	COX16	P47081	118 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	BUD9	P53226	547 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	COQ6	P53318	479 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.18	□□□□□ -1.58	not detected
UBX2	YML013W	STP1	Q00947	519 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	ARG7	Q04728	441 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	IVY1	Q04934	453 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	CDA2	Q06703	312 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	CRT10	Q08226	957 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	NRT1	Q08485	598 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	MHF1	Q3E835	90 aa		5.18	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YCR015C	P25616	317 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	FUN26	P31381	517 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	GSH1	P32477	678 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	NDC1	P32500	655 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	SPO23	P33757	523 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	ZRT3	P34240	503 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YMR262W	P38430	313 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YIR035C	P40579	254 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	AIM22	P47051	409 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	LYS5	P50113	272 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	DIA3	P52290	468 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RSM27	P53305	110 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	EFM6	P53970	246 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	TIM44	Q01852	431 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	NUP49	Q02199	472 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	GRX5	Q02784	150 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	AIM36	Q03798	255 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	ESA1	Q08649	445 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YPR063C	Q12160	140 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		5.17	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	RHO2	P06781	192 aa		5.16	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		5.16	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	CHS2	P14180	963 aa		5.16	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	PDE1	P22434	369 aa		5.16	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	ERG9	P29704	444 aa		5.16	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	COQ2	P32378	372 aa		5.16	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	ALG14	P38242	237 aa		5.16	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	ARN1	P38731	627 aa		5.16	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	GET2	P40056	285 aa		5.16	□□□□□ -1.58
UBX2	YML013W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58

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