RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC24Q50LG9 513 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 TEX11Q8IYF3 940 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 UBALD2Q8IYN6 164 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 STK35Q8TDR2 534 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 RTKNQ9BST9 563 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 NRSN2Q9GZP1 204 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJC18Q9H819 358 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 SAMM50Q9Y512 469 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ZZEF1O43149 2961 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 GRIN2DO15399 1336 aa4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 DSPP15924 2871 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 BPTFQ12830 3046 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1671Q9BY89 1806 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 TM4SF5O14894 197 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 FLOT1O75955 427 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 HLA-DOAP06340 250 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 LDHCP07864 332 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF853P0CG23 659 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ARNTP27540 789 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ETFBP38117 255 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP2K3P46734 347 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMC6P62333 389 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 GNAI1P63096 354 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 GSTO1P78417 241 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 HYAL1Q12794 435 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC14Q15048 493 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 G2E3Q7L622 706 aa4.89□□□□□ -1.63
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ECHDC1-211ENST00000460558 SULF2Q8IWU5 870 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC105Q8IYK2 499 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 DCLK2Q8N568 766 aa4.89□□□□□ -1.63
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ECHDC1-211ENST00000460558 C8orf58Q8NAV2 365 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ELOA3Q8NG57 546 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 NKD1Q969G9 470 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX11Q96FC9 970 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 MSLNLQ96KJ4 702 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 AP5M1Q9H0R1 490 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 IGFLR1Q9H665 355 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 INCENPQ9NQS7 918 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 IFT57Q9NWB7 429 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 STARD13Q9Y3M8 1113 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 FRYQ5TBA9 3013 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.89□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 H3BM21 787 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 H3BRJ5 948 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ATE1O95260 518 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 SELPP16109 830 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 EPHA1P21709 976 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 GIPRP48546 466 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 MECOMQ03112 1051 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 TNFAIP2Q03169 654 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 COASYQ13057 564 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 AP3B2Q13367 1082 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAM15Q13444 863 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB33AQ14088 237 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 IKBKEQ14164 716 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM132BQ14DG7 1078 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.88□□□□□ -1.63
ECHDC1-211ENST00000460558 PPM1JQ5JR12 505 aa4.88□□□□□ -1.63
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