RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452148.2

PCAT7-201, prostate cancer associated transcript 7, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PCAT7, Length 1,164 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT7-201ENST00000452148 DGKIO75912 1065 aa20.15■□□□□ 0.82
PCAT7-201ENST00000452148 ERVK-21P61565 698 aa20.15■□□□□ 0.82
PCAT7-201ENST00000452148 PTGDRQ13258 359 aa20.15■□□□□ 0.82
PCAT7-201ENST00000452148 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PCAT7-201ENST00000452148 ODR4Q5SWX8 454 aa20.15■□□□□ 0.82
PCAT7-201ENST00000452148 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.15■□□□□ 0.82
PCAT7-201ENST00000452148 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.15■□□□□ 0.82
PCAT7-201ENST00000452148 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.15■□□□□ 0.82
PCAT7-201ENST00000452148 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PCAT7-201ENST00000452148 RGS18Q9NS28 235 aa20.15■□□□□ 0.82
PCAT7-201ENST00000452148 DENND3A2RUS2 1198 aa20.14■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 LYPLA2O95372 231 aa20.14■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 GATMP50440 423 aa20.14■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 GRB10Q13322 594 aa20.14■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.14■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 NEK9Q8TD19 979 aa20.14■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 LPXNO60711 386 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 RFC5P40937 340 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 DSC3Q14574 896 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 FIBCD1Q8N539 461 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 NLRP4Q96MN2 994 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.13■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 TTC3P53804 2025 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 C9IYK1 514 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 CDC42EP1Q00587 391 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 EMC2Q15006 297 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 IL17AQ16552 155 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 EPC2Q52LR7 807 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 PPME1Q9Y570 386 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.12■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 STAG3L1P0CL83 205 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 RARRES1P49788 294 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 FAM189BP81408 668 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 ECM1Q16610 540 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 TMEM192Q8IY95 271 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 MTRQ99707 1265 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.11■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 RPA1P27694 616 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 POTEGQ6S5H5 508 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 FERMT3Q86UX7 667 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 ZNF410Q86VK4 478 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 ERMNQ8TAM6 284 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 TCP11Q8WWU5 503 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 MYO9BQ13459 2157 aa20.1■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 PP2D1A8MPX8 630 aa20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 LINC00271P0C7V0 271 aa20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 CDC25AP30304 524 aa20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 PDIA5Q14554 519 aa20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 NACC1Q96RE7 527 aa20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 ARID2Q68CP9 1835 aa20.09■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 COL4A6Q14031 1691 aa20.08■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 DGAT1O75907 488 aa20.08■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 FGFR1P11362 822 aa20.08■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.08■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.08■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 RNF149Q8NC42 400 aa20.08■□□□□ 0.81
PCAT7-201ENST00000452148 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 298.6 ms