RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 FERMT3Q86UX7 667 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-211ENST00000429595 NOX5Q96PH1 765 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-211ENST00000429595 BCL11AQ9H165 835 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRK-211ENST00000429595 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.15□□□□□ -1.1
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PTPRK-211ENST00000429595 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
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PTPRK-211ENST00000429595 GJA8P48165 433 aa8.12□□□□□ -1.11
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PTPRK-211ENST00000429595 RNF34Q969K3 372 aa8.12□□□□□ -1.11
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PTPRK-211ENST00000429595 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-211ENST00000429595 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-211ENST00000429595 RAET1EQ8TD07 263 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-211ENST00000429595 BORCS6Q96GS4 357 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-211ENST00000429595 PEX11GQ96HA9 241 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-211ENST00000429595 LNPKQ9C0E8 428 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-211ENST00000429595 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-211ENST00000429595 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-211ENST00000429595 INSRRP14616 1297 aa8.08□□□□□ -1.12
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