RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.77■■□□□ 1.24
PITX3-201ENST00000370002 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.77■■□□□ 1.24
PITX3-201ENST00000370002 CHST12Q9NRB3 414 aa22.77■■□□□ 1.24
PITX3-201ENST00000370002 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.77■■□□□ 1.24
PITX3-201ENST00000370002 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 KIF2CQ99661 725 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 SIP14410 1827 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 RFC5P40937 340 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 ST3GAL1Q11201 340 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 COL19A1Q14993 1142 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 NEK9Q8TD19 979 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 NLRP7Q8WX94 980 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 AAASQ9NRG9 546 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 DACT1Q9NYF0 836 aa22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 TNFRSF10AO00220 468 aa22.75■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 LYPLA2O95372 231 aa22.75■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 TFF2Q03403 129 aa22.75■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 CALCRLQ16602 461 aa22.75■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 SCLT1Q96NL6 688 aa22.75■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.75■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 TTC28Q96AY4 2481 aa22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 A0A0U1RQF3 1178 aa22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 EOMESO95936 686 aa22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 C8orf76Q96K31 380 aa22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 CEP170P1Q96L14 293 aa22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 MTMR9Q96QG7 549 aa22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 LXNQ9BS40 222 aa22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 ASAP2O43150 1006 aa22.73■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 NEMFO60524 1076 aa22.73■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 UBE3AQ05086 875 aa22.73■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.73■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.73■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.73■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.73■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.73■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 FAM205CA6NFA0 338 aa22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 DTNBO60941 627 aa22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 SLITRK3O94933 977 aa22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 SKIP12755 728 aa22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 DRP2Q13474 957 aa22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 RABEP1Q15276 862 aa22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 TCP11Q8WWU5 503 aa22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 REV3LO60673 3130 aa22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 CARNS1A5YM72 827 aa22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 TMEM150BA6NC51 233 aa22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 GRM6O15303 877 aa22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 TRAPPC10P48553 1259 aa22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 RGL1Q9NZL6 768 aa22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PITX3-201ENST00000370002 A0A087WZ62 844 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 KCNQ1P51787 676 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 NPEPPSP55786 919 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 DYDC2Q96IM9 177 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 MUC3AQ02505 3323 aa22.7■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 ST18O60284 1047 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 ITGB1P05556 798 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 POU5F1BQ06416 359 aa22.69■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PITX3-201ENST00000370002 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms