RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 NFS1Q9Y697 457 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 P4HA2O15460 535 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 TTI1O43156 1089 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ZBTB7AO95365 584 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 MAPK7Q13164 816 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 VCXQ9H320 206 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 USP17L3A6NCW0 530 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 USP17L4A6NCW7 530 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 SNAP23O00161 211 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ZPR1O75312 459 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 NR3C1P04150 777 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 PLTPP55058 493 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 IL9RQ01113 521 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 MFSD5Q6N075 450 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 IWS1Q96ST2 819 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 PPIP5K2O43314 1243 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 TLR2O60603 784 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 NOL4O94818 638 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ECEL1O95672 775 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 TTLL1O95922 423 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 TMOD1P28289 359 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 STX2P32856 288 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ZNF76P36508 570 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ATP2B2Q01814 1243 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ICA1Q05084 483 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 E2F5Q15329 346 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 JAMLQ86YT9 394 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 KIFAP3Q92845 792 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 SAAL1Q96ER3 474 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 KCND2Q9NZV8 630 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 SENP1Q9P0U3 644 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 NUP98P52948 1817 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 POTEMA6NI47 508 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 ATP2A1O14983 1001 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 CYTH3O43739 400 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 DCTN3O75935 186 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 POLD1P28340 1107 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 GALCP54803 685 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 DUPD1Q68J44 220 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 TRIM11Q96F44 468 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-202ENST00000320122 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ZBTB5O15062 677 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ATP2B4P23634 1241 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PON1P27169 355 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PRDX5P30044 214 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GCKP35557 465 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TMC4Q7Z404 712 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PNMA2Q9UL42 364 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SPOPO43791 374 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GCNT3O95395 438 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TDP2O95551 362 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms