RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 SMC2O95347 1197 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 MORC3Q14149 939 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 SFR1Q86XK3 245 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 HBP1O60381 514 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 UNC13DQ70J99 1090 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 KSR1Q8IVT5 923 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 BSNDQ8WZ55 320 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.59■□□□□ 0.89
PRRT1-201ENST00000211413 BECN2A8MW95 431 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 CASP5P51878 434 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 EMC2Q15006 297 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 GSDMAQ96QA5 445 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 EXOC1Q9NV70 894 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.58■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 HAS3O00219 553 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 KLRC1P26715 233 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 CLCN3P51790 818 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP12P59046 1061 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PPFIA1Q13136 1202 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 GRIK4Q16099 956 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF20Q3BBV1 942 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MYCT1Q8N699 235 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 METTL13Q8N6R0 699 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 FAM167AQ96KS9 214 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 GRIN2DO15399 1336 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 FAM13AO94988 1023 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 GUCY2CP25092 1073 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 SLC26A2P50443 739 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.57■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 DGAT1O75907 488 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 RHOBTB3O94955 611 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 EHHADHQ08426 723 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 LRMPQ12912 555 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 RNF180Q86T96 592 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF333Q96JL9 665 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.56■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 C22orf31O95567 290 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MYBP10242 640 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ACLYP53396 1101 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PEX3P56589 373 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 TREHO43280 583 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MYL1P05976 194 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PRCPP42785 496 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 NKX3-2P78367 333 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 KCNA1Q09470 495 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ODR4Q5SWX8 454 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 FIZ1Q96SL8 496 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 USP20Q9Y2K6 914 aa20.55■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 STX17P56962 302 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 KCNB1Q14721 858 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PARVGQ9HBI0 331 aa20.54■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 MSCO60682 206 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.53■□□□□ 0.88
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.53■□□□□ 0.88
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