RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559396.5

DCAF11-222, Transcript of DDB1 and CUL4 associated factor 11, human

TSL 3

Gene DCAF11, Length 300 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCAF11-222	ENST00000559396	TYRO3	Q06418	890 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	FUT2	Q10981	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	TCP10	Q12799	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	NFIA	Q12857	509 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	NR5A1	Q13285	461 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	STIM1	Q13586	685 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CAMK4	Q16566	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	OXER1	Q8TDS5	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CEP63	Q96MT8	703 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	DSE	Q9UL01	958 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396		A0A087WWV3	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396		A0A1W2PQ27	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396		A0A1W2PQ64	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396		A0A1W2PQD8	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	POTEF	A5A3E0	1075 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396		E7ENQ6	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	PSMD14	O00487	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	SLC26A4	O43511	780 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	IDH3B	O43837	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	AKR1B10	O60218	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	TSPAN1	O60635	241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	HIP1R	O75146	1068 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	RNF40	O75150	1001 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	TACC1	O75410	805 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	RAD17	O75943	681 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	GDF11	O95390	407 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	GHR	P10912	638 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	PFKFB1	P16118	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	KRT4	P19013	534 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	LMNB1	P20700	586 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	KCNA3	P22001	575 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	ENPP1	P22413	925 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	IL4R	P24394	825 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	KRT9	P35527	623 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CD97	P48960	835 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	IRAK1	P51617	712 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	CCNG1	P51959	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	NDUFA8	P51970	172 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	DR1	Q01658	176 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	RASSF7	Q02833	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	GABPA	Q06546	454 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	XRCC4	Q13426	336 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DCAF11-222	ENST00000559396	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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