RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBLCQ9ULV8 474 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2orf71A6NGG8 1288 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNC119BA6NIH7 251 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARNTLO00327 626 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRID2O43424 1007 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCR1O76036 304 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 BPNT1O95861 308 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD247P20963 164 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 BMPR1AP36894 532 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEPHS1P49903 392 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 BLOC1S1P78537 153 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFF2Q03403 129 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEMA3AQ14563 771 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 BMT2Q1RMZ1 405 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PHC3Q8NDX5 983 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC4DQ8WXI8 215 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
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RNU6-871P-201ENST00000516122 C12orf49Q9H741 205 aa0.55□□□□□ -2.32
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC17A6Q9P2U8 582 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM8A1Q9UBU6 413 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHST2Q9Y4C5 530 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa0.55□□□□□ -2.32
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RNU6-871P-201ENST00000516122 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa0.54□□□□□ -2.32
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ABL1P00519 1130 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRG2P13727 222 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 NME1P15531 152 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GRIN1Q05586 938 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 DSC3Q14574 896 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP0.54□□□□□ -2.32
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RNU6-871P-201ENST00000516122 LLGL1Q15334 1064 aa0.53□□□□□ -2.32
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RNU6-871P-201ENST00000516122 DPY19L1Q2PZI1 675 aa0.53□□□□□ -2.32
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RNU6-871P-201ENST00000516122 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO27Q8NI29 283 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 NSMCE1Q8WV22 266 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 COPS5Q92905 334 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 UROC1Q96N76 676 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLITRK1Q96PX8 696 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC9A7Q96T83 725 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBCK1Q9BYM8 510 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIPK2Q9H2X6 1198 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 TELO2Q9Y4R8 837 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF26BQ2KJY2 2108 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A087WZG4 1122 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM90A10PA6NDY2 464 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-871P-201ENST00000516122 EYA4O95677 639 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-871P-201ENST00000516122 WT1P19544 449 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADCY8P40145 1251 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCL6P41182 706 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
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