RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 NUP62CLQ9H1M0 184 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 CLSTN2Q9H4D0 955 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SERTAD1Q9UHV2 236 aa13.02□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TMEM265A0A087WTH1 108 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 E9PMD0 336 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 HAS3O00219 553 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SORBS3O60504 671 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 DGAT1O75907 488 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 STBD1O95210 358 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SMC2O95347 1197 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 GNAT1P11488 350 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 RARRES1P49788 294 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SLC12A3P55017 1021 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PLCB4Q15147 1175 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 LRRC41Q15345 812 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 UGCGQ16739 394 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 XKR9Q5GH70 373 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ANO5Q75V66 913 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 USP38Q8NB14 1042 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PAGE5Q96GU1 130 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 C7orf25Q9BPX7 421 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 BHMT2Q9H2M3 363 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 CYP26B1Q9NR63 512 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ODF2LQ9ULJ1 636 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 NRCAMQ92823 1304 aa13.01□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 MAGEB2O15479 319 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PGK1P00558 417 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 MYL3P08590 195 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ATP4AP20648 1035 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SCP2P22307 547 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 GUCY2CP25092 1073 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ITGB8P26012 769 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PSEN2P49810 448 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PSMC6P62333 389 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TLE2Q04725 743 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SNX17Q15036 470 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 POSTNQ15063 836 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 KCNA10Q16322 511 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TPRNQ4KMQ1 711 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 KCNK18Q7Z418 384 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ZNF710Q8N1W2 664 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 MCPH1Q8NEM0 835 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PIGOQ8TEQ8 1089 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 CEP170P1Q96L14 293 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 GSDMAQ96QA5 445 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TRPC6Q9Y210 931 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ASGR1P07306 291 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 CYP11B2P19099 503 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ABCD1P33897 745 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 EPHB4P54760 987 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 BEX3Q00994 111 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 MCM6Q14566 821 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 MFSD10Q14728 455 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 RINT1Q6NUQ1 792 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 NFRKBQ6P4R8 1299 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PADI6Q6TGC4 694 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 C1orf186Q6ZWK4 172 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SESTD1Q86VW0 696 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 GPBP1Q86WP2 473 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 RETREG2Q8NC44 543 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TCP11Q8WWU5 503 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SLC7A3Q8WY07 619 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 KAT2BQ92831 832 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 GLT1D1Q96MS3 346 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PLIN2Q99541 437 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TRIM9Q9C026 710 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 C17orf75Q9HAS0 396 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 RMND1Q9NWS8 449 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SEL1LQ9UBV2 794 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PHF24Q9UPV7 400 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TELO2Q9Y4R8 837 aa12.99□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 MAFO75444 373 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 KRT18P05783 430 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 CLTBP09497 229 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ZNF286BP0CG31 522 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 RAG1P15918 1043 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 GAP43P17677 238 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 DNM2P50570 870 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 ACLYP53396 1101 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 CDC42EP1Q00587 391 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 PSMD2Q13200 908 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 KCNB1Q14721 858 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 GRIN2CQ14957 1233 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0753Q2KHM9 967 aa12.98□□□□□ -0.33
NISCH-211ENST00000488243 NT5DC1Q5TFE4 455 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 299.3 ms